دوره 30، شماره 10 - ( دی 1398 )
جلد 30 شماره 10 صفحات 830-819 |
برگشت به فهرست نسخه ها
Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
Abedi Gaballu F, Mansoori B, Dehghan G. EVALUATION OF HMGA2 AND SMARCA5 GENES EXPRESSION IN 4T1 CELLS EXPOSED TO METHOTREXATE: BIOINFORMATIC AND EXPERIMENTAL STUDY. Studies in Medical Sciences 2019; 30 (10) :819-830
URL: http://umj.umsu.ac.ir/article-1-4903-fa.html
URL: http://umj.umsu.ac.ir/article-1-4903-fa.html
عابدی گبلو فریدون، منصوری بهزاد، دهقان غلامرضا. ارزیابی بیان ژنهای HMGA2 و SMARCA5 در سلولهای 4T1 در معرض متوتروکسات: مطالعه‌ی بیوانفورماتیکی و تجربی. مجله مطالعات علوم پزشکی. 1398; 30 (10) :819-830
استاد بیوشیمی، گروه زیست شناسی جانوری، دانشکده علوم طبیعی، دانشگاه تبریز، تبریز، ایران (نویسنده مسئول) ، dehghan2001d@yahoo.com
چکیده: (3481 مشاهده)
پیش‌زمینه و هدف: سرطان پستان یکی از جدیترین تهدیدکننده‌های حیات انسان است و بعد از سرطان ریه به‌عنوان دومین سرطان شایع در میان زنان مطرح است. هدف از پژوهش حاضر ارزیابی بیوانفورماتیکی و تجربی تأثیر متوتروکسات بر بیان ژنهای HMGA2 و SMARCA5 در رده سلولی 4T1 سرطان پستان، تیمار شده با داروی متوتروکسات میباشد.
مواد و روش کار: برای انجام این مطالعه، ابتدا داده‌های میکروآرایه از پایگاه داده GEO جمع‌آوری‌شده و با استفاده از جعبه‌ابزار شبکه عصبی (PNN) در نرم‌افزار MATLAB 2018a آنالیز شد. در مرحلهی بعد، پرایمرهای ویژه ژنهای HMGA2 و SMARCA5 طراحی شدند. سمیت سلولی متوتروکسات روی رده سلولی 4T1 به روش MTT ارزیابی شد. و درنهایت تأثیر دارو بر بیان ژنهای HMGA2 و SMARCA5 به روش Real-time PCR ارزیابی شد.
یافته‌ها: نتایج حاصل از آنالیز بیوانفورماتیکی نشان داد که متوتروکسات سطح بیان ژنهای HMGA2 و SMARCA5 را به ترتیب کاهش و افزایش داد. ارزیابی سمیت سلولی با استفاده از آزمون MTT نشان داد که متوتروکسات زنده‌مانی سلولهای 4T1 را به‌صورت وابسته به غلظت دارو کاهش داد و همچنین در غلظت µg/ml 208 رشد 50 درصد از سلولها مهار میشود. نتایج مربوط به Real-time PCR نشان داد که سطح بیان ژن HMGA2 به‌طور معنیداری (p≤ 0.05) کاهش یافت، این در حالی است که بیان ژن SMARCA5 به‌صورت معنیداری (p≤0.05) افزایش یافت که با نتایج آنالیز بیوانفورماتیکی همخوانی دارد.
بحث و نتیجه‌گیری: نتایج به‌دست‌آمده پیشنهاد میکند که ژنهای HMGA2 و SMARCA5 احتمالاً به‌عنوان ژنهای هدف متوتروکسات در درمان سرطان پستان استفاده شوند. البته برای تأیید یافتههای این پژوهش مطالعات بیشتری باید انجام گیرد.
مواد و روش کار: برای انجام این مطالعه، ابتدا داده‌های میکروآرایه از پایگاه داده GEO جمع‌آوری‌شده و با استفاده از جعبه‌ابزار شبکه عصبی (PNN) در نرم‌افزار MATLAB 2018a آنالیز شد. در مرحلهی بعد، پرایمرهای ویژه ژنهای HMGA2 و SMARCA5 طراحی شدند. سمیت سلولی متوتروکسات روی رده سلولی 4T1 به روش MTT ارزیابی شد. و درنهایت تأثیر دارو بر بیان ژنهای HMGA2 و SMARCA5 به روش Real-time PCR ارزیابی شد.
یافته‌ها: نتایج حاصل از آنالیز بیوانفورماتیکی نشان داد که متوتروکسات سطح بیان ژنهای HMGA2 و SMARCA5 را به ترتیب کاهش و افزایش داد. ارزیابی سمیت سلولی با استفاده از آزمون MTT نشان داد که متوتروکسات زنده‌مانی سلولهای 4T1 را به‌صورت وابسته به غلظت دارو کاهش داد و همچنین در غلظت µg/ml 208 رشد 50 درصد از سلولها مهار میشود. نتایج مربوط به Real-time PCR نشان داد که سطح بیان ژن HMGA2 به‌طور معنیداری (p≤ 0.05) کاهش یافت، این در حالی است که بیان ژن SMARCA5 به‌صورت معنیداری (p≤0.05) افزایش یافت که با نتایج آنالیز بیوانفورماتیکی همخوانی دارد.
بحث و نتیجه‌گیری: نتایج به‌دست‌آمده پیشنهاد میکند که ژنهای HMGA2 و SMARCA5 احتمالاً به‌عنوان ژنهای هدف متوتروکسات در درمان سرطان پستان استفاده شوند. البته برای تأیید یافتههای این پژوهش مطالعات بیشتری باید انجام گیرد.
نوع مطالعه: پژوهشي(توصیفی- تحلیلی) |
موضوع مقاله:
داروسازی
ارسال پیام به نویسنده مسئول
| بازنشر اطلاعات | |
 |
این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است. |
