دوره 30، شماره 6 - ( شهریور 1398 )
جلد 30 شماره 6 صفحات 486-475 |
برگشت به فهرست نسخه ها
Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
Abedi Gaballu F, Mansoori B, Dehghan G. STUDY OF HMGA2 GENE INHIBITION WITH SPECIFIC SHRNA AND SIRNA AND INVESTIGATION OF CORRESPONDING EFFECTS ON DOWNSTREAM GENE EXPRESSION IN MDA-MB-231 CANCER CELLS: A BIOINFORMATIC AND EXPERIMENTAL STUDY. Studies in Medical Sciences 2019; 30 (6) :475-486
URL: http://umj.umsu.ac.ir/article-1-4753-fa.html
URL: http://umj.umsu.ac.ir/article-1-4753-fa.html
عابدی گبلو فریدون، منصوری بهزاد، دهقان غلامرضا. مطالعه مهار ژن HMGA2 با shRNA و siRNA اختصاصی و بررسی تأثیر آن‌ها بر بیان ژن‌های پایین‌دست در سلول‌های سرطانی MDA-MB-231: مطالعه بیوانفورماتیکی و تجربی. مجله مطالعات علوم پزشکی. 1398; 30 (6) :475-486
استاد بیوشیمی، گروه زیست شناسی جانوری، دانشکده علوم طبیعی، دانشگاه تبریز، تبریز، ایران (نویسنده مسئول) ، dehghan2001d@yahoo.com
چکیده: (3370 مشاهده)
پیش‌زمینه و هدف: امروزه استفاده از siRNA برای خاموش‌سازی ژن‌ها به‌صورت فزاینده‌ای در حال افزایش است. هدف از مطالعه حاضر بررسی بیوانفورماتیکی و تجربی مهار ژن HMGA2 و تأثیر آن بر میزان بیان ژن‌های پایین‌دست (ژن‌های انکوژنی و سرکوب‌کننده توموری) در سلول‌های MDA-MB-231 تیمار شده با shRNA و siRNA اختصاصی HMGA2 است.
مواد و روش کار: برای انجام این پژوهش بیوانفورماتیکی و تجربی، ابتدا داده‌های میکروآرایه از پایگاه داده GEO جمع‌آوری‌شده و با استفاده از جعبه‌ابزار شبکه عصبی (PNN ) در نرم‌افزار MATLAB 2018a آنالیز شد. سپس siRNA اختصاصی HMGA2 طراحی و تهیه شد. انتقال siRNA به‌وسیله لیپوفکتأمین صورت گرفته و بیان ژن HMGA2 و ژن‌های انکوژنی و سرکوب‌کننده توموری به روش Real-time PCR ارزیابی شد.
یافته‌ها: نتایج حاصل از مطالعه بیوانفورماتیکی نشان داد که ژن HMGA2 ارتباط نزدیکی با ژن‌های پایین‌دست دارد، به‌طوری‌که تغییر در بیان ژن HMGA2 بیان ژن‌های پایین‌دست را نیز تحت تأثیر قرار می‌دهد. انتقال siRNA اختصاصی HMGA2 به داخل سلول MDA-MB-231 باعث مهار معنی‌دار (p< 0.05 ) بیان ژن HMGA2 در مقایسه با گروه کنترل شد. به‌علاوه به دنبال سرکوب بیان ژن HMGA2، بیان ژن‌های انکوژنی (TERT) و سرکوب‌کننده تومور DEDD)) به‌صورت معنی‌داری (p< 0.05 ) به ترتیب کاهش و افزایش یافتند.
بحث و نتیجه‌گیری: ژن HMGA2 به دلیل ارتباط گسترده با ژن‌های انکوژنی و سرکوب‌کننده تومور انتخاب معقول برای هدف‌گیری و خاموش‌سازی به‌وسیله siRNA اختصاصی است. نتیجه مهار موفقیت‌آمیز بیان ژن HMGA2 و تأثیرپذیری بیان ژن‌های TERT و DEDD بعد از ترانسفکشن siRNA اختصاصی با نتایج حاصل از مطالعه بیوانفورماتیکی مطابقت دارد.
مواد و روش کار: برای انجام این پژوهش بیوانفورماتیکی و تجربی، ابتدا داده‌های میکروآرایه از پایگاه داده GEO جمع‌آوری‌شده و با استفاده از جعبه‌ابزار شبکه عصبی (PNN ) در نرم‌افزار MATLAB 2018a آنالیز شد. سپس siRNA اختصاصی HMGA2 طراحی و تهیه شد. انتقال siRNA به‌وسیله لیپوفکتأمین صورت گرفته و بیان ژن HMGA2 و ژن‌های انکوژنی و سرکوب‌کننده توموری به روش Real-time PCR ارزیابی شد.
یافته‌ها: نتایج حاصل از مطالعه بیوانفورماتیکی نشان داد که ژن HMGA2 ارتباط نزدیکی با ژن‌های پایین‌دست دارد، به‌طوری‌که تغییر در بیان ژن HMGA2 بیان ژن‌های پایین‌دست را نیز تحت تأثیر قرار می‌دهد. انتقال siRNA اختصاصی HMGA2 به داخل سلول MDA-MB-231 باعث مهار معنی‌دار (p< 0.05 ) بیان ژن HMGA2 در مقایسه با گروه کنترل شد. به‌علاوه به دنبال سرکوب بیان ژن HMGA2، بیان ژن‌های انکوژنی (TERT) و سرکوب‌کننده تومور DEDD)) به‌صورت معنی‌داری (p< 0.05 ) به ترتیب کاهش و افزایش یافتند.
بحث و نتیجه‌گیری: ژن HMGA2 به دلیل ارتباط گسترده با ژن‌های انکوژنی و سرکوب‌کننده تومور انتخاب معقول برای هدف‌گیری و خاموش‌سازی به‌وسیله siRNA اختصاصی است. نتیجه مهار موفقیت‌آمیز بیان ژن HMGA2 و تأثیرپذیری بیان ژن‌های TERT و DEDD بعد از ترانسفکشن siRNA اختصاصی با نتایج حاصل از مطالعه بیوانفورماتیکی مطابقت دارد.
نوع مطالعه: پژوهشي(توصیفی- تحلیلی) |
موضوع مقاله:
اونکولوژی
ارسال پیام به نویسنده مسئول
| بازنشر اطلاعات | |
 |
این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است. |
