دوره 34، شماره 9 - ( آذر 1402 )
جلد 34 شماره 9 صفحات 494-486 |
برگشت به فهرست نسخه ها
Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
Asl Soleimani E, Mojtahedi A, Zaboli F, Kaboosi H. Hypervirulence of Klebsiella Pneumoniae Strains Producing Carbapenemase and Extended-Spectrum Beta-Lactamase (ESBLs) Isolated from Hospitals of Rasht, Iran. Studies in Medical Sciences 2023; 34 (9) :486-494
URL: http://umj.umsu.ac.ir/article-1-6041-fa.html
URL: http://umj.umsu.ac.ir/article-1-6041-fa.html
اصل سلیمانی الهام، مجتهدی علی، زابلی فاطمه، کابوسی حامی. هایپر ویرولانس در گونه‌های کلبسیلا پنومونیه مولد کارباپنماز و
بالاکتامازهای وسیع‌الطیف، جدا شده از بیمارستانهای رشت. مجله مطالعات علوم پزشکی. 1402; 34 (9) :486-494
گروه میکروب شناسی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی ایران، تهران، ایران ، mojtahedii.ali@gmail.com
متن کامل [PDF 379 kb]
(423 دریافت)
| چکیده (HTML) (1199 مشاهده)
جدول (1): پرایمرهای مورد استفاده برای تکثیر ژن‌های مورد مطالعه
جدول (2): شیوع ESBL و blaNDM-1 1 در انواع مختلف توالی
متن کامل: (612 مشاهده)
مقدمه
کلبسیلا پنومونیه از اعضای خانواده انتروباکتریاسه، یک باسیل گرم منفی بی‌هوازی اختیاری و اکسیداز منفی است. این باکتری یکی از علل عمده عفونت‌های بیمارستانی در سراسر جهان است و به‌طور گسترده‌ای در آب، فاضلاب، خاک، گیاهان و سطوح مخاطی پستانداران یافت می‌شود (1). کلبسیلا پنومونیه عامل ایجادکننده عفونت‌های متعددی در انسان ازجمله پنومونی، سپسیس، عفونت مجاری ادراری، مننژیت و آبسه‌های شکمی است (2). طی برآوردهای اخیر، شیوع جهانی این باکتری در عفونت‌های بیمارستانی چیزی حدود 32 درصد است (3). عوامل متعددی به‌عنوان ریسک فاکتور کسب عفونت بیمارستانی کلبسیلا پنومونیه شامل کهولت سن، بدخیمی، دیابت، بیماری مزمن کبد، پیوند اعضا و دیالیز گزارش شده‌اند. همچنین سایر فاکتورهای ریسک عفونت بیمارستانی شامل درمان با کورتیکواستروئیدها، شیمی‌درمانی و یا کاتترگزاری نیز در مواردی گزارش گردیده است (4, 5).
در طی چند دهه گذشته، افزایش مقاومت در برابر طیف وسیعی از آنتی‌بیوتیک‌ها توسط سویههای کلاسیک کلبسیلا پنومونیه گزارش شده است. شواهد نشان داده‌اند که خطر مرگ ناشی از کلبسیلا پنومونیه مقاوم به کارباپنم در کلبسیلا پنومونیه خطر مرگ را به‌طور چشم‌گیری نسبت به کلبسیلا پنومونیه حساس به کارباپنم افزایش یافته است. همچنین گزارش شده است که مرگ‌ومیر ناشی از کلبسیلا پنومونیه مقاوم به کارباپنم در صورت همراهی با بیماری‌های همراه به‌صورت چشم‌گیری افزایش یافته است (6). درنتیجه این مقاومت آنتی‌بیوتیکی، عوامل اتیولوژیک باکتریایی عفونت‌های دستگاه ادراری، تنفسی و گردش خون نسبت به درمان مقاوم شده‌اند. دو نوع عمده از مقاومت آنتی‌بیوتیکی در سویههای کلبسیلا پنومونیه مشاهده شده است. یکی از مکانیسم‌ها بیان بتالاکتامازهای وسیع‌الطیف یا (Extended-spectrum β-lactamases= ESBLs) است که باعث می‌شود باکتری مقاوم به سفالوسپورین ها و مونوباکتام ها باشد (7, 8). مکانیسم دیگر مقاومت که حتی بیشتر نگران کننده است، بیان کارباپنماز توسط باکتری می‌باشد، که کلبسیلا پنومونیه را به تمام بتا لاکتام های موجود از جمله کارباپنم ها مقاوم می‌سازد. صرف نظر از نوع آنزیم کارباپنمازی که حمل می‌کنند، ایزوله‌های کلبسیلا پنومونیه مقاوم به کارباپنم را (Carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae = CRKP) می‌نامند (9). با توجه به کمبود درمان‌های مؤثر در دسترس، عفونت‌های حاصل از ایزوله‌های مولد ESBLs و آنزیم‌های کارباپنماز می‌توانند منجر به میزان قابل‌توجهی از و مرگ‌ومیر در مقایسه با عفونت با باکتری‌های غیرمقاوم شوند (7, 9).
در گذشته بیشتر عفونت‌های ایجاد شده توسط سویههای کلاسیک کلبسیلا پنومونیه در افراد بستری در بیمارستان به وقوع می‌‌‌‌پیوست. سویههای جدید به شدت بیماری‌زا در چند سال اخیر به وجود آمده‌اند و منجر به ایجاد عفونت‌های تهدیدکننده حیات در افراد جوان و سالم گردیده است. این سویه‌ها در ابتدا از کشور چین گزارش شدند اما بعد از آن در سایر کشورها نیز گزارش‌هایی دیده شد. سویههای به شدت بیماری‌زا به‌صورت بالینی تعریف شدند و از انواع ابتدایی این سویه‌ها که سویههای کلاسیک باشند جداسازی شدند. میزان مرگ‌ومیر بالایی برای سویههای به شدت بیماری‌زا نسبت به سویههای کلاسیک گزارش شده است. عوامل متعددی در افزایش شیوع این سویه‌ها نقش دارند نقش دارد که حاصل تغییر ژنتیک باکتری در تعامل با محیط است. این عوامل تحت تأثیر مصرف بیش‌ازحد و نادرست آنتی‌بیوتیک‌ها، انتقال در محیطهای پر خطر مانند بیمارستان‌ها به افراد با شرایط ایمنی نامساعد، جابه جایی بین مناطق و کشورهای مختلف و درمان‌های ناکامل و ناصحیح عفونت می‌باشد (10, 11).
بیماریزایی شدیدتر سویههای به شدت بیماری‌زای کلبسیلا پنومونیه را به توانایی بالقوه بیشتر این سویه‌ها در تولید فاکتورهای بیماری‌زا و مقاومت آنتی‌بیوتیکی آن نسبت می‌دهند. در این راستا نشان داده شده است که سویههای به شدت بیماری‌زا بیشتر در توالی یابی (Sequence type = ST) اپیدمیک خاصی مشاهده می‌شوند. این توالی بطور معمول شامل توالی اپیدمیک مقاوم به کارباپنم نوع 285 (ST258) و نیز به جمعیت دیگر شامل ST23، ST86 و ST65 تعلق دارند (10, 12).
با توجه به اینکه تاکنون مطالعه‌ای مشابه جهت بررسی فراوانی تولید ESBLs و کرباپنماز ها در سویههای به شدت بیماری‌زا کلبسیلا پنومونیه در شمال ایران انجام نشده است، در مطالعه حاضر ضمن بررسی این موارد در سویههای کلبسیلا پنومونیه جدا شده از بیماران بستری در بیمارستانهای آموزشی شهر رشت، شیوع توالی اپیدمیک نیز به روش مولکولی بررسی گردید. تعیین میزان شیوع این سویه‌ها ازنظر اپیدمیولوژی حائز اهمیت بوده و در کنترل عفونت‌های ناشی از این باکتری و استراتژی‌های درمان می‌تواند کمک کننده باشد.
مواد و روش‌ها
طراحی مطالعه:
این مطالعه از نوع مقطعی می‌باشد که 158 ایزوله کلبسیلا پنومونیه از نمونه‌های بالینی (شامل: ادرار، خون، زخم و کاتتر (لوله‌ی تراشه)) بیماران بستری 1 سال تا 83 ساله در بیمارستانهای رازی، پورسینا، رسول اکرم، گلسار و الزهرای شهر رشت در بازه‌ی زمانی از اول مهر 1398 تا پایان شهریور 1399 جدا شد و بر اساس پروتکل استاندارد در محیط انتقالی Tryptone soy agar (TSA) جهت بررسی و هویت یابی به آزمایشگاه مولکولی انتقال داده شد. طراحی و فرایند انجام این مطالعه توسط کمیته اخلاق دانشگاه علوم پزشکی گیلان مورد بررسی وتایید قرار گرفت (IR.GUMS.REC.1398.297).
نمونه‌گیری و تعیین هویت باکتریایی:
به منظور تأیید هویت باکتری‌ها، نمونه‌ها در محیطهای کشت Blood agar و McConkey agar کشت داده شده و در انکوباتور 37 درجه سانتیگراد به مدت 24 ساعت انکوبه گردیدند. روی کلنیهای ایجاد شده، رنگآمیزی گرم انجام شد و باسیلهای گرم منفی که ازنظر تست اکسیداز منفی بودند کشت خالص از آن‌ها به عمل آمده و در محیطهای کشت افتراقی از قبیل TSI، Simmons’ citrate، SIM، MR-VP، Urea و LIA کشت داده شد و در انکوباتور 37 درجه سانتیگراد به مدت 24 ساعت انکوبه گردید. سویههای کلبسیلا پنومونیه بر اساس نتایج واکنشها در محیطهای کشت افتراقی تعیین هویت و با شناسایی ژن 16s با تکنیک PCR تأیید گردید (12).
تعیین سویههای به شدت بیماری‌زا:
برای انجام این تست لوپ استاندارد را بروی سطح کلنی در محیط آگار قرار داده و پس از جدا کردن لوپ از محیط و حرکت آن به سمت بالا روی محیط حاوی آگار، یک‌رشته چسبناک تولید شده که طول بیشتر از 5 میلیمتر را به‌عنوان تست استرینگ مثبت در نظر گرفته شد (13). این سویه‌ها به‌عنوان غربالگری اولیه کلبسیلا پنومونیه به شدت بیماری‌زا در نظر گرفته شدند.
تعیین سویههای تولیدکنندهی ESBL به روش فنوتیپی:
برای تعیین سویههای تولیدکنندهی ESBL ازنظر فنوتیپی طبق دستورالعمل CLSI، از تست CDT استفاده شد. طبق این تست از یک دیسک آنتیبیوتیک سفوتاکسیم و یک دیسک سفوتاکسیم -کلاوولانیک اسید و سفتازیدم و سفتازیدیم -کلاوولانیک اسید استفاده شد. سویههایی که هالهی عدم رشدشان با دیسک حاوی کلاوولانیک اسید حداقل 5 میلیمتر یا بیشتر از دیسک بدون کلاوولانیک اسید بود به عنوان سویههای تولیدکنندهی ESBL شناسایی شدند (14). از کلبسیلا پنومونیه ATCC 700603 به عنوان کنترل مثبت و از اشریشیا کلای ATCC 25922 به عنوان کنترل منفی برای تشخیص سویههای تولیدکننده ESBL استفاده شد.
استخراج ژنوم و روش‌های مولکولی:
ژنوم باکتریایی توسط روش جوشاندن بر اساس پروتک: ل معرفی شده توسط نوبری و همکاران (انتشار سلولی، لیز سلولی و جداسازی) صورت پذیرفت (15). سپس تعیین حضور ژن کد کننده کرباپنماز NDM-1 و همچنین تایپینگ سویههای هایپر ویرولانت برای مشخص شدن سکانس تایپ‌های ST23، ST65، ST86 و ST258 به کمک پرایمرهای اختصاصی و به روش PCR در حجم واکنش 15 میکرولیتر انجام پذیرفت (مرحله دناتوراسیون اولیه 94 درجه سانتیگراد به مدت 10 دقیقه، به دنبال آن 35 چرخه در دمای 94 درجه سانتیگراد برای 30 ثانیه، 60-72 درجه سانتیگراد برای 30-60 ثانیه، و مرحله نهایی افزایش 72 درجه سانتی گراد به مدت 5 دقیقه) (جدول 1) (12, 16). محصولات PCR بر روی ژل آگارز 1 درصد حاوی Sybrsafe الکتروفورز گردیده و در دستگاه Gel doc زیر نور UV مشاهده‌گردید.
آنالیز آماری:
نتایج به کمک نرم افزار SPSS نسخه 24 آنالیز گردید. نتایج بصورت آمار توصیفی بیان گردید. درصد و فراوانی برای داده‌های کیفی و میانگین برای گزارش داده‌های کمی استفاده شد.
یافته‌ها
در این مطالعه، 158 ایزوله کلبسیلا پنومونیه جدا شده از نمونه‌های مختلف جمع‌آوری و مورد بررسی قرار گرفت. همه جدایه‌ها به روش فنوتیپی مورد تأیید قرار گرفتند. پس از آن تمام ایزوله‌ها با استفاده از روش مولکولی ازنظر ژنوتیپی نیز مورد تأیید قرار گرفتند. درمجموع از 158 ایزوله کلبسیلا پنومونیه جدا شده از بیماران در بخش‌های مختلف بیمارستان تعداد 55 ایزوله (8/34 درصد) از 55 بیمار بستری (27 زن و 28 مرد) استرینگ تست مثبت و به‌عنوان به شدت بیماری‌زا مشخص شدند.
از مجموع 55 ایزوله کلبسیلا پنومونیه هایپرویرولانت، 28 (9/50 درصد) ایزوله از مردان و 27 (1/49 درصد) ایزوله از زنان جدا شد. محدوده سنی بیماران 1 سال تا 83 ساله (میانگین سنی 5/37 سال) بود. تست CDT بر روی 55 جدایه کلبسیلا پنومونیه انجام شد و از مجموع 55 سویه‌ی کلبسیلا پنومونیه جدا شده 16 (1/29 درصد) ایزوله ازنظر فنوتیپی ESBL مثبت بودند. نتایج حاصل از تکثیر ژن blaNDM-1 بر روی 55 ایزوله کلبسیلا پنومونیه هایپر ویرولانت نشان داد که فقط ۲ ایزوله (6/3 درصد) دارای ژن تولیدکننده کرباپنماز NDM-1 بودند. نتایج مولکولی فراوانی سکانس تایپ‌های شایع در ایزوله‌های کلبسیلا پنومونیه هایپرویرولانت را 1/9 درصد برای ST258، 1/9 درصد برای ST86 و 6/3 درصد برای ST23 نشان داد. همچنین ST65 در هیچ ایزوله‌ای مشاهده نگردید. جدول 2 فراوانی ایزوله‌های ایزوله‌های تولیدکننده ESBL و کربانماز NDM-1 را به تفکیک ساکانس تایپ‌های اپیدمیک نشان می‌دهد.
کلبسیلا پنومونیه از اعضای خانواده انتروباکتریاسه، یک باسیل گرم منفی بی‌هوازی اختیاری و اکسیداز منفی است. این باکتری یکی از علل عمده عفونت‌های بیمارستانی در سراسر جهان است و به‌طور گسترده‌ای در آب، فاضلاب، خاک، گیاهان و سطوح مخاطی پستانداران یافت می‌شود (1). کلبسیلا پنومونیه عامل ایجادکننده عفونت‌های متعددی در انسان ازجمله پنومونی، سپسیس، عفونت مجاری ادراری، مننژیت و آبسه‌های شکمی است (2). طی برآوردهای اخیر، شیوع جهانی این باکتری در عفونت‌های بیمارستانی چیزی حدود 32 درصد است (3). عوامل متعددی به‌عنوان ریسک فاکتور کسب عفونت بیمارستانی کلبسیلا پنومونیه شامل کهولت سن، بدخیمی، دیابت، بیماری مزمن کبد، پیوند اعضا و دیالیز گزارش شده‌اند. همچنین سایر فاکتورهای ریسک عفونت بیمارستانی شامل درمان با کورتیکواستروئیدها، شیمی‌درمانی و یا کاتترگزاری نیز در مواردی گزارش گردیده است (4, 5).
در طی چند دهه گذشته، افزایش مقاومت در برابر طیف وسیعی از آنتی‌بیوتیک‌ها توسط سویههای کلاسیک کلبسیلا پنومونیه گزارش شده است. شواهد نشان داده‌اند که خطر مرگ ناشی از کلبسیلا پنومونیه مقاوم به کارباپنم در کلبسیلا پنومونیه خطر مرگ را به‌طور چشم‌گیری نسبت به کلبسیلا پنومونیه حساس به کارباپنم افزایش یافته است. همچنین گزارش شده است که مرگ‌ومیر ناشی از کلبسیلا پنومونیه مقاوم به کارباپنم در صورت همراهی با بیماری‌های همراه به‌صورت چشم‌گیری افزایش یافته است (6). درنتیجه این مقاومت آنتی‌بیوتیکی، عوامل اتیولوژیک باکتریایی عفونت‌های دستگاه ادراری، تنفسی و گردش خون نسبت به درمان مقاوم شده‌اند. دو نوع عمده از مقاومت آنتی‌بیوتیکی در سویههای کلبسیلا پنومونیه مشاهده شده است. یکی از مکانیسم‌ها بیان بتالاکتامازهای وسیع‌الطیف یا (Extended-spectrum β-lactamases= ESBLs) است که باعث می‌شود باکتری مقاوم به سفالوسپورین ها و مونوباکتام ها باشد (7, 8). مکانیسم دیگر مقاومت که حتی بیشتر نگران کننده است، بیان کارباپنماز توسط باکتری می‌باشد، که کلبسیلا پنومونیه را به تمام بتا لاکتام های موجود از جمله کارباپنم ها مقاوم می‌سازد. صرف نظر از نوع آنزیم کارباپنمازی که حمل می‌کنند، ایزوله‌های کلبسیلا پنومونیه مقاوم به کارباپنم را (Carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae = CRKP) می‌نامند (9). با توجه به کمبود درمان‌های مؤثر در دسترس، عفونت‌های حاصل از ایزوله‌های مولد ESBLs و آنزیم‌های کارباپنماز می‌توانند منجر به میزان قابل‌توجهی از و مرگ‌ومیر در مقایسه با عفونت با باکتری‌های غیرمقاوم شوند (7, 9).
در گذشته بیشتر عفونت‌های ایجاد شده توسط سویههای کلاسیک کلبسیلا پنومونیه در افراد بستری در بیمارستان به وقوع می‌‌‌‌پیوست. سویههای جدید به شدت بیماری‌زا در چند سال اخیر به وجود آمده‌اند و منجر به ایجاد عفونت‌های تهدیدکننده حیات در افراد جوان و سالم گردیده است. این سویه‌ها در ابتدا از کشور چین گزارش شدند اما بعد از آن در سایر کشورها نیز گزارش‌هایی دیده شد. سویههای به شدت بیماری‌زا به‌صورت بالینی تعریف شدند و از انواع ابتدایی این سویه‌ها که سویههای کلاسیک باشند جداسازی شدند. میزان مرگ‌ومیر بالایی برای سویههای به شدت بیماری‌زا نسبت به سویههای کلاسیک گزارش شده است. عوامل متعددی در افزایش شیوع این سویه‌ها نقش دارند نقش دارد که حاصل تغییر ژنتیک باکتری در تعامل با محیط است. این عوامل تحت تأثیر مصرف بیش‌ازحد و نادرست آنتی‌بیوتیک‌ها، انتقال در محیطهای پر خطر مانند بیمارستان‌ها به افراد با شرایط ایمنی نامساعد، جابه جایی بین مناطق و کشورهای مختلف و درمان‌های ناکامل و ناصحیح عفونت می‌باشد (10, 11).
بیماریزایی شدیدتر سویههای به شدت بیماری‌زای کلبسیلا پنومونیه را به توانایی بالقوه بیشتر این سویه‌ها در تولید فاکتورهای بیماری‌زا و مقاومت آنتی‌بیوتیکی آن نسبت می‌دهند. در این راستا نشان داده شده است که سویههای به شدت بیماری‌زا بیشتر در توالی یابی (Sequence type = ST) اپیدمیک خاصی مشاهده می‌شوند. این توالی بطور معمول شامل توالی اپیدمیک مقاوم به کارباپنم نوع 285 (ST258) و نیز به جمعیت دیگر شامل ST23، ST86 و ST65 تعلق دارند (10, 12).
با توجه به اینکه تاکنون مطالعه‌ای مشابه جهت بررسی فراوانی تولید ESBLs و کرباپنماز ها در سویههای به شدت بیماری‌زا کلبسیلا پنومونیه در شمال ایران انجام نشده است، در مطالعه حاضر ضمن بررسی این موارد در سویههای کلبسیلا پنومونیه جدا شده از بیماران بستری در بیمارستانهای آموزشی شهر رشت، شیوع توالی اپیدمیک نیز به روش مولکولی بررسی گردید. تعیین میزان شیوع این سویه‌ها ازنظر اپیدمیولوژی حائز اهمیت بوده و در کنترل عفونت‌های ناشی از این باکتری و استراتژی‌های درمان می‌تواند کمک کننده باشد.
مواد و روش‌ها
طراحی مطالعه:
این مطالعه از نوع مقطعی می‌باشد که 158 ایزوله کلبسیلا پنومونیه از نمونه‌های بالینی (شامل: ادرار، خون، زخم و کاتتر (لوله‌ی تراشه)) بیماران بستری 1 سال تا 83 ساله در بیمارستانهای رازی، پورسینا، رسول اکرم، گلسار و الزهرای شهر رشت در بازه‌ی زمانی از اول مهر 1398 تا پایان شهریور 1399 جدا شد و بر اساس پروتکل استاندارد در محیط انتقالی Tryptone soy agar (TSA) جهت بررسی و هویت یابی به آزمایشگاه مولکولی انتقال داده شد. طراحی و فرایند انجام این مطالعه توسط کمیته اخلاق دانشگاه علوم پزشکی گیلان مورد بررسی وتایید قرار گرفت (IR.GUMS.REC.1398.297).
نمونه‌گیری و تعیین هویت باکتریایی:
به منظور تأیید هویت باکتری‌ها، نمونه‌ها در محیطهای کشت Blood agar و McConkey agar کشت داده شده و در انکوباتور 37 درجه سانتیگراد به مدت 24 ساعت انکوبه گردیدند. روی کلنیهای ایجاد شده، رنگآمیزی گرم انجام شد و باسیلهای گرم منفی که ازنظر تست اکسیداز منفی بودند کشت خالص از آن‌ها به عمل آمده و در محیطهای کشت افتراقی از قبیل TSI، Simmons’ citrate، SIM، MR-VP، Urea و LIA کشت داده شد و در انکوباتور 37 درجه سانتیگراد به مدت 24 ساعت انکوبه گردید. سویههای کلبسیلا پنومونیه بر اساس نتایج واکنشها در محیطهای کشت افتراقی تعیین هویت و با شناسایی ژن 16s با تکنیک PCR تأیید گردید (12).
تعیین سویههای به شدت بیماری‌زا:
برای انجام این تست لوپ استاندارد را بروی سطح کلنی در محیط آگار قرار داده و پس از جدا کردن لوپ از محیط و حرکت آن به سمت بالا روی محیط حاوی آگار، یک‌رشته چسبناک تولید شده که طول بیشتر از 5 میلیمتر را به‌عنوان تست استرینگ مثبت در نظر گرفته شد (13). این سویه‌ها به‌عنوان غربالگری اولیه کلبسیلا پنومونیه به شدت بیماری‌زا در نظر گرفته شدند.
تعیین سویههای تولیدکنندهی ESBL به روش فنوتیپی:
برای تعیین سویههای تولیدکنندهی ESBL ازنظر فنوتیپی طبق دستورالعمل CLSI، از تست CDT استفاده شد. طبق این تست از یک دیسک آنتیبیوتیک سفوتاکسیم و یک دیسک سفوتاکسیم -کلاوولانیک اسید و سفتازیدم و سفتازیدیم -کلاوولانیک اسید استفاده شد. سویههایی که هالهی عدم رشدشان با دیسک حاوی کلاوولانیک اسید حداقل 5 میلیمتر یا بیشتر از دیسک بدون کلاوولانیک اسید بود به عنوان سویههای تولیدکنندهی ESBL شناسایی شدند (14). از کلبسیلا پنومونیه ATCC 700603 به عنوان کنترل مثبت و از اشریشیا کلای ATCC 25922 به عنوان کنترل منفی برای تشخیص سویههای تولیدکننده ESBL استفاده شد.
استخراج ژنوم و روش‌های مولکولی:
ژنوم باکتریایی توسط روش جوشاندن بر اساس پروتک: ل معرفی شده توسط نوبری و همکاران (انتشار سلولی، لیز سلولی و جداسازی) صورت پذیرفت (15). سپس تعیین حضور ژن کد کننده کرباپنماز NDM-1 و همچنین تایپینگ سویههای هایپر ویرولانت برای مشخص شدن سکانس تایپ‌های ST23، ST65، ST86 و ST258 به کمک پرایمرهای اختصاصی و به روش PCR در حجم واکنش 15 میکرولیتر انجام پذیرفت (مرحله دناتوراسیون اولیه 94 درجه سانتیگراد به مدت 10 دقیقه، به دنبال آن 35 چرخه در دمای 94 درجه سانتیگراد برای 30 ثانیه، 60-72 درجه سانتیگراد برای 30-60 ثانیه، و مرحله نهایی افزایش 72 درجه سانتی گراد به مدت 5 دقیقه) (جدول 1) (12, 16). محصولات PCR بر روی ژل آگارز 1 درصد حاوی Sybrsafe الکتروفورز گردیده و در دستگاه Gel doc زیر نور UV مشاهده‌گردید.
آنالیز آماری:
نتایج به کمک نرم افزار SPSS نسخه 24 آنالیز گردید. نتایج بصورت آمار توصیفی بیان گردید. درصد و فراوانی برای داده‌های کیفی و میانگین برای گزارش داده‌های کمی استفاده شد.
یافته‌ها
در این مطالعه، 158 ایزوله کلبسیلا پنومونیه جدا شده از نمونه‌های مختلف جمع‌آوری و مورد بررسی قرار گرفت. همه جدایه‌ها به روش فنوتیپی مورد تأیید قرار گرفتند. پس از آن تمام ایزوله‌ها با استفاده از روش مولکولی ازنظر ژنوتیپی نیز مورد تأیید قرار گرفتند. درمجموع از 158 ایزوله کلبسیلا پنومونیه جدا شده از بیماران در بخش‌های مختلف بیمارستان تعداد 55 ایزوله (8/34 درصد) از 55 بیمار بستری (27 زن و 28 مرد) استرینگ تست مثبت و به‌عنوان به شدت بیماری‌زا مشخص شدند.
از مجموع 55 ایزوله کلبسیلا پنومونیه هایپرویرولانت، 28 (9/50 درصد) ایزوله از مردان و 27 (1/49 درصد) ایزوله از زنان جدا شد. محدوده سنی بیماران 1 سال تا 83 ساله (میانگین سنی 5/37 سال) بود. تست CDT بر روی 55 جدایه کلبسیلا پنومونیه انجام شد و از مجموع 55 سویه‌ی کلبسیلا پنومونیه جدا شده 16 (1/29 درصد) ایزوله ازنظر فنوتیپی ESBL مثبت بودند. نتایج حاصل از تکثیر ژن blaNDM-1 بر روی 55 ایزوله کلبسیلا پنومونیه هایپر ویرولانت نشان داد که فقط ۲ ایزوله (6/3 درصد) دارای ژن تولیدکننده کرباپنماز NDM-1 بودند. نتایج مولکولی فراوانی سکانس تایپ‌های شایع در ایزوله‌های کلبسیلا پنومونیه هایپرویرولانت را 1/9 درصد برای ST258، 1/9 درصد برای ST86 و 6/3 درصد برای ST23 نشان داد. همچنین ST65 در هیچ ایزوله‌ای مشاهده نگردید. جدول 2 فراوانی ایزوله‌های ایزوله‌های تولیدکننده ESBL و کربانماز NDM-1 را به تفکیک ساکانس تایپ‌های اپیدمیک نشان می‌دهد.
جدول (1): پرایمرهای مورد استفاده برای تکثیر ژن‌های مورد مطالعه
| نام | Nucleotide (5’ to 3’) | رفرانس |
| Khe (16S) | CCGGAGCGTTTTTCAATCGGCG | 12 |
| CGCTTCGCCCCTCACCTGAAAT | ||
| pilV | CGATGGCGCTGGCGACGATTAT | |
| CCCGATGGGCAAGAACATGCGT | ||
| kphp | TGGCGGGTAATGCCCGATCAGT | |
| AGGCCGCTTTCCATAAGCCGTT | ||
| pilL | CGGTATTTGCTCTGCGTGATAG | |
| TGGTTATACAGAACGGCATTGG | ||
| ST65 | GCTATGCCAATGCCGGAACCGT | |
| ACCCACCCCCGTAAAGATGGCA | ||
| ST23 | ACGCATGCCTACAGGACATCGAA | |
| TCCAGTAGGAGCAGACAGCGGA | ||
| ST86 | TATTCTTTCTAGGGGCCGAATG | |
| TCACCAGCTCACTTGAACATTA | ||
| NDM | GGTTTGGCGATCTGGTTTTC | 16 |
| CGGAATGGCTCATCACGATC |
جدول (2): شیوع ESBL و blaNDM-1 1 در انواع مختلف توالی
| STs | ESBL Positive | blaNDM-1 Positive | مجموع |
| ST258 | 0 | 0 | 5 |
| ST86 | 2 | 0 | 5 |
| ST23 | 1 | 2 | 2 |
| ST65 | 0 | 0 | 0 |
| Total | 3/16 (18.75%) | 2/2 (100%) | 12/55 (21.8%) |
بحث و نتیجه‌گیری
عفونت‌های تهاجمی کلبسیلا پنومونیه هایپر ویرولانت نسبت به نوع کلاسیک خطرات بسیار بیشتری دارند (17). این ویژگی‌های پاتوژنیک در سویههای به شدت بیماری‌زا ممکن است در ابتدا مربوط به ویژگی‌های ویرولانس این باکتری‌ها باشد ولی مکانیسم دقیق آن هنوز ناشناخته باقی مانده است. در مطالعه حاضر 8/34 درصد از ایزوله‌ها به شدت بیماری‌زا به حساب آمدند. مطالعه‌ای در ایران (کرمان) در سال 2019 شیوع سویههای به شدت بیماری‌زای جدا شده از بیماران بستری در بیمارستان را 1/15 درصدگزارش کرد (18). در مطالعه شجاع و همکاران که در جنوب ایران انجام شد، نتایج نشان داد که فقط 4 درصد از جدایه‌های کلبسیلا پنومونیه جدا شده از نمونه‌های بالینی، به عنوان به شدت بیماری‌زا شناسایی شدند (19). که این نتیجه کمترین درصد گزارش شده از مطالعات انجام شده در ایران می‌باشد. بر اساس مطالعه تبریزی و همکاران 4/9 درصد جدایه‌ها سویه به شدت بیماری‌زا کلبسیلا پنومونیه جدا شده از پنومونی مرتبط با ونتیلاتور را تشکیل دادند که در بین بیمارانی که با مسمومیت حاد دارویی در بخش مراقبت‌های ویژه بستری شده بودند، جداسازی شدند (20). نتایج ترقیان و همکاران در شهر اصفهان نشان داد که 8/16 درصد از جدایه‌های کلبسیلا پنومونیه پس از بررسی‌های فنوتیپی و ژنوتیپی به عنوان به شدت بیماری‌زا شناسایی شدند (21).
علاوه بر این در مطالعه سانبخانی و همکاران در تهران، نتایج نشان داد که پس از بررسی‌های فنوتیپی و ژنوتیپی، 102 ایزوله (6/62 درصد) از جدایه‌ها به عنوان به شدت بیماری‌زا شناسایی شدند (22). همچنین نتایج نشان داد که بیش از 50 درصد از جدایه‌ها از بیماران بستری در بخش مراقبت‌های ویژه بستری بوده‌اند. همچنین در یک مطالعه متاآنالیزی که در توسط سانی خانی و همکاران سال 2021 انجام شد و به بررسی شیوع سویههای به شدت بیماری‌زای کلبسیلا پنومونیه پرداخت، نتایج نشان داد که از بین 1814 ایزوله مورد بررسی در 14 مطالعه در سرتاسر دنیا، 7/21 درصد از ایزوله‌ها به عنوان به شدت بیماری‌زا گزارش شدند (23). در حالیکه در سایر مناطق آسیا درصدهای بالاتری از شیوع به شدت بیماری‌زا گزارش شده است. اگرچه عفونت اولیه با این گونه سویه‌ها در ابتدا در بیماران سرپایی دیده شده است؛ اما عفونت در سیستم‌های بهداشتی نیز توصیف شده است. بنابراین تماس داشتن با کارکنان مراکز بهداشتی و یا حتی اشیا و وسایل موجود در بخش‌های متفاوت مراکز بهداشتی مکانیزم های ممکن برای اکتساب این نوع از عفونت می‌باشند.
در بررسی‌های فنوتیپی تشخیص سویههای ESBL در مطالعه حاضر، 29 درصد از جدایه‌های کلبسیلا پنومونیه ESBL مثبت بودند. اولین مورد از شیوع ESBL ها در سویههای به شدت بیماری‌زا در سال 2014 از چین گزارش شد و 2 سال بعد از آن در فرانسه نیز اولین مورد ابتلای همزمان سویههای هایپر ویرولانت ESBL مشاهده شد (24, 25). در مطالعات مشابه در چین در سال 2014، 17 درصد از جدایه‌ها فنوتیپ ESBL را از خود بروز دادند (26). همچنین در مطالعه دیگری در چین در همان سال شیوع ESBL در بین ایزوله‌های هایپر ویرولانت 5/12 درصد گزارش شد، که تا سال 2019 میزان شیوع ESBL ها در میان ایزوله‌های به شدت بیماری‌زا به 3/16 درصد رسیده بود (27). در ایران در مطالعه‌ای در سال 2021 در اصفهان، بین جدایه‌ها به شدت بیماری‌زا فروانی ESBL ها 5/40 درصد گزارش شد (21). در مطالعه فرهادی و همکاران در شمال ایران (2021)، میزان شیوع ESBL در بین جدایه‌های کلاسیک کلبسیلا پنومونیه 64 درصد گزارش شد که از نتایج مطالعه حاضر بیشتر می‌باشد (28). ازنظر آماری شیوع ESBLs در ایران نسبت به سراسر کشورهای جهان و حتی آسیا چشمگیرتر است. یکی از مهم‌ترین دلایل آن می‌توان استفاده بیش‌ازحد و نابجا از داروهای بتا لاکتام بخصوص استفاده از سفالوسپورین‌های وسیع‌الطیف را نام برد. بنابراین یک اقدام مفید و مؤثر در زمینه کنترل عفونت‌های مقاوم به درمان می‌تواند کاهش مصرف نادرست‌های آنتی‌بیوتیک‌ها و استفاده اصولی از آن‌ها باشد.
بررسی STs یک روش مبتنی بر توالی نوکلئوتید است که برای توصیف روابط ژنتیکی بین جدایه‌های باکتریایی کفایت می‌کند (29). این روش داده‌های قابل‌مقایسه و بدون ابهام در مکان‌های مختلف را ارائه می‌دهد تا بین افراد استفاده‌کننده از این روش در سراسر جهان قابل‌ارائه و بحث باشد (29). سه نوع ST متفاوت در ایزوله‌های به شدت بیماری‌زا در این مطالعه حاصل شد که شایع‌ترین ST ها، ST86، ST23 و ST258 بودند. در یک مطالعه متاانالیز که در سال 2021 انجام گرفت، 14 مطالعه بررسی شد و نتایج نشان داد که از بین 394 ایزوله به شدت بیماری‌زا، 50 توالی متفاوت شناسایی شده است. ازاین‌بین، ST23، ST11، ST65 و ST86 فراوان‌ترین ST ها بودند (23). در مطالعه سهرابی و همکاران در سال 2022، نتایج نشان داد که از بین 4 ایزوله به شدت بیماری‌زای کلبسیلا پنومونیه، سه ایزوله متعلق به ST23 و یک ایزوله متعلق به ST65 بود (30). همچنین مشابه با نتایج مطالعه اخیر، بیش از این نیز در کشور انگلیس حضور ژن کارباپنماز blaNDM-1 در ایزوله‌های هایپر ویرولانت کلبسیلا پنمونیه متعلق به توالی اپیدمیک ST23 گزارش شده است (31).
مطالعه حاضر نشان داد که ایزوله‌های به شدت بیماری‌زا کلبسیلا پنومونیه فروانی قابل‌توجه ای دارند. همچنین نتایج نشان داد که درصد قابل‌توجهی از ایزوله‌ها توانایی تولید آنزیم‌های ESBLs و کارباپنماز را دارند. بدون شک ظهور سویههای با ریسک بالا در منطقه در آینده باعث کاهش انتخاب آنتیبیوتیک مناسب برای درمان عفونت‌های شدید می‌شود و در نهایت تهدید جدی برای سیستم سلامت و بهداشت کشور می‌باشد. استفاده از آنتی‌بیوتیک‌ها به‌صورت ایمن و مؤثر از اهمیت بالایی برخوردار است. برای کنترل شیوع سویههای به شدت بیماری‌زای کلبسیلا پنومونیه، باید از آنتی‌بیوتیک‌ها به طریقی استفاده شود که عفونت‌ها کنترل شده و به‌طور همزمان مقاومت آنتی‌بیوتیکی کاهش یابد. برای این منظور، باید دستورالعمل‌های مقامات بهداشتی و داروسازی را رعایت کنید. این شامل تعیین درست نوع آنتیبیوتیک، مدت‌زمان استفاده مناسب، دوز و روش مصرف صحیح است. همچنین، استفاده غیرضروری یا نادرست از آنتی‌بیوتیک‌ها باید به حداقل رسانده شود تا مقاومت آنتی‌بیوتیکی در بین باکتری‌ها کاهش یابد. از طرف دیگر، ضروری است که سیستم نظارت مداوم و برنامه‌های شدید کنترل عفونت بیمارستانی برای جلوگیری از انتشار بیشتر در مراکز درمانی و جامعه به کار گرفته شود. برای این منظور، ارائه آموزش به کارکنان بهداشتی و پرستاران درباره خطرات و روش‌های پیشگیری از عفونت‌های سویههای به شدت بیماری‌زای کلبسیلا پنومونیه حائز اهمیت است. آموزش‌ها شامل استفاده صحیح از ضدعفونی کننده‌ها، بهداشت دست، مدیریت صحیح عفونت و روش‌های پیشگیری در بستر بیمارستان است. علاوه بر آموزش، کنترل عفونت‌های بیمارستانی نیز باید به‌طور جدی پیگیری شود. اتخاذ تدابیر مناسب برای کنترل و پیشگیری از عفونت‌های بیمارستانی در بخش‌های مختلف، از جمله عفونت‌های ناشی از کلبسیلا پنومونیه، از اهمیت ویژه‌ای برخوردار است. با همکاری تیم‌های بهداشتی و مدیریتی بیمارستان، پزشکان و کادر درمانی، می‌توان به عنوانی شیوع سویههای هایپر ویرولانت کلبسیلا پنومونیه را کاهش داد و محیطی ایمن‌تر را برای بیماران فراهم کرد.
ملاحظات اخلاقی
این مطالعه با شناسه اخلاق [IR.GUMS.REC.1398.297] در سامانه اخلاق پژوهشهای زیستی علوم پزشکی گیلان تصویب شد.
حمایت مالی
این مطالعه تحت حمایت مالی هیچ سازمان و موسسه‌ای نبوده است.
تعارض منافع
هیچ تعارض منافعی توسط نویسندگان اعلام نشد.
تشکر و قدردانی
نویسندگان این مقاله کمال تشکر را از تمامی کادر درمان بیمارستان جهت همکاری در این مطالعه را دارند.
عفونت‌های تهاجمی کلبسیلا پنومونیه هایپر ویرولانت نسبت به نوع کلاسیک خطرات بسیار بیشتری دارند (17). این ویژگی‌های پاتوژنیک در سویههای به شدت بیماری‌زا ممکن است در ابتدا مربوط به ویژگی‌های ویرولانس این باکتری‌ها باشد ولی مکانیسم دقیق آن هنوز ناشناخته باقی مانده است. در مطالعه حاضر 8/34 درصد از ایزوله‌ها به شدت بیماری‌زا به حساب آمدند. مطالعه‌ای در ایران (کرمان) در سال 2019 شیوع سویههای به شدت بیماری‌زای جدا شده از بیماران بستری در بیمارستان را 1/15 درصدگزارش کرد (18). در مطالعه شجاع و همکاران که در جنوب ایران انجام شد، نتایج نشان داد که فقط 4 درصد از جدایه‌های کلبسیلا پنومونیه جدا شده از نمونه‌های بالینی، به عنوان به شدت بیماری‌زا شناسایی شدند (19). که این نتیجه کمترین درصد گزارش شده از مطالعات انجام شده در ایران می‌باشد. بر اساس مطالعه تبریزی و همکاران 4/9 درصد جدایه‌ها سویه به شدت بیماری‌زا کلبسیلا پنومونیه جدا شده از پنومونی مرتبط با ونتیلاتور را تشکیل دادند که در بین بیمارانی که با مسمومیت حاد دارویی در بخش مراقبت‌های ویژه بستری شده بودند، جداسازی شدند (20). نتایج ترقیان و همکاران در شهر اصفهان نشان داد که 8/16 درصد از جدایه‌های کلبسیلا پنومونیه پس از بررسی‌های فنوتیپی و ژنوتیپی به عنوان به شدت بیماری‌زا شناسایی شدند (21).
علاوه بر این در مطالعه سانبخانی و همکاران در تهران، نتایج نشان داد که پس از بررسی‌های فنوتیپی و ژنوتیپی، 102 ایزوله (6/62 درصد) از جدایه‌ها به عنوان به شدت بیماری‌زا شناسایی شدند (22). همچنین نتایج نشان داد که بیش از 50 درصد از جدایه‌ها از بیماران بستری در بخش مراقبت‌های ویژه بستری بوده‌اند. همچنین در یک مطالعه متاآنالیزی که در توسط سانی خانی و همکاران سال 2021 انجام شد و به بررسی شیوع سویههای به شدت بیماری‌زای کلبسیلا پنومونیه پرداخت، نتایج نشان داد که از بین 1814 ایزوله مورد بررسی در 14 مطالعه در سرتاسر دنیا، 7/21 درصد از ایزوله‌ها به عنوان به شدت بیماری‌زا گزارش شدند (23). در حالیکه در سایر مناطق آسیا درصدهای بالاتری از شیوع به شدت بیماری‌زا گزارش شده است. اگرچه عفونت اولیه با این گونه سویه‌ها در ابتدا در بیماران سرپایی دیده شده است؛ اما عفونت در سیستم‌های بهداشتی نیز توصیف شده است. بنابراین تماس داشتن با کارکنان مراکز بهداشتی و یا حتی اشیا و وسایل موجود در بخش‌های متفاوت مراکز بهداشتی مکانیزم های ممکن برای اکتساب این نوع از عفونت می‌باشند.
در بررسی‌های فنوتیپی تشخیص سویههای ESBL در مطالعه حاضر، 29 درصد از جدایه‌های کلبسیلا پنومونیه ESBL مثبت بودند. اولین مورد از شیوع ESBL ها در سویههای به شدت بیماری‌زا در سال 2014 از چین گزارش شد و 2 سال بعد از آن در فرانسه نیز اولین مورد ابتلای همزمان سویههای هایپر ویرولانت ESBL مشاهده شد (24, 25). در مطالعات مشابه در چین در سال 2014، 17 درصد از جدایه‌ها فنوتیپ ESBL را از خود بروز دادند (26). همچنین در مطالعه دیگری در چین در همان سال شیوع ESBL در بین ایزوله‌های هایپر ویرولانت 5/12 درصد گزارش شد، که تا سال 2019 میزان شیوع ESBL ها در میان ایزوله‌های به شدت بیماری‌زا به 3/16 درصد رسیده بود (27). در ایران در مطالعه‌ای در سال 2021 در اصفهان، بین جدایه‌ها به شدت بیماری‌زا فروانی ESBL ها 5/40 درصد گزارش شد (21). در مطالعه فرهادی و همکاران در شمال ایران (2021)، میزان شیوع ESBL در بین جدایه‌های کلاسیک کلبسیلا پنومونیه 64 درصد گزارش شد که از نتایج مطالعه حاضر بیشتر می‌باشد (28). ازنظر آماری شیوع ESBLs در ایران نسبت به سراسر کشورهای جهان و حتی آسیا چشمگیرتر است. یکی از مهم‌ترین دلایل آن می‌توان استفاده بیش‌ازحد و نابجا از داروهای بتا لاکتام بخصوص استفاده از سفالوسپورین‌های وسیع‌الطیف را نام برد. بنابراین یک اقدام مفید و مؤثر در زمینه کنترل عفونت‌های مقاوم به درمان می‌تواند کاهش مصرف نادرست‌های آنتی‌بیوتیک‌ها و استفاده اصولی از آن‌ها باشد.
بررسی STs یک روش مبتنی بر توالی نوکلئوتید است که برای توصیف روابط ژنتیکی بین جدایه‌های باکتریایی کفایت می‌کند (29). این روش داده‌های قابل‌مقایسه و بدون ابهام در مکان‌های مختلف را ارائه می‌دهد تا بین افراد استفاده‌کننده از این روش در سراسر جهان قابل‌ارائه و بحث باشد (29). سه نوع ST متفاوت در ایزوله‌های به شدت بیماری‌زا در این مطالعه حاصل شد که شایع‌ترین ST ها، ST86، ST23 و ST258 بودند. در یک مطالعه متاانالیز که در سال 2021 انجام گرفت، 14 مطالعه بررسی شد و نتایج نشان داد که از بین 394 ایزوله به شدت بیماری‌زا، 50 توالی متفاوت شناسایی شده است. ازاین‌بین، ST23، ST11، ST65 و ST86 فراوان‌ترین ST ها بودند (23). در مطالعه سهرابی و همکاران در سال 2022، نتایج نشان داد که از بین 4 ایزوله به شدت بیماری‌زای کلبسیلا پنومونیه، سه ایزوله متعلق به ST23 و یک ایزوله متعلق به ST65 بود (30). همچنین مشابه با نتایج مطالعه اخیر، بیش از این نیز در کشور انگلیس حضور ژن کارباپنماز blaNDM-1 در ایزوله‌های هایپر ویرولانت کلبسیلا پنمونیه متعلق به توالی اپیدمیک ST23 گزارش شده است (31).
مطالعه حاضر نشان داد که ایزوله‌های به شدت بیماری‌زا کلبسیلا پنومونیه فروانی قابل‌توجه ای دارند. همچنین نتایج نشان داد که درصد قابل‌توجهی از ایزوله‌ها توانایی تولید آنزیم‌های ESBLs و کارباپنماز را دارند. بدون شک ظهور سویههای با ریسک بالا در منطقه در آینده باعث کاهش انتخاب آنتیبیوتیک مناسب برای درمان عفونت‌های شدید می‌شود و در نهایت تهدید جدی برای سیستم سلامت و بهداشت کشور می‌باشد. استفاده از آنتی‌بیوتیک‌ها به‌صورت ایمن و مؤثر از اهمیت بالایی برخوردار است. برای کنترل شیوع سویههای به شدت بیماری‌زای کلبسیلا پنومونیه، باید از آنتی‌بیوتیک‌ها به طریقی استفاده شود که عفونت‌ها کنترل شده و به‌طور همزمان مقاومت آنتی‌بیوتیکی کاهش یابد. برای این منظور، باید دستورالعمل‌های مقامات بهداشتی و داروسازی را رعایت کنید. این شامل تعیین درست نوع آنتیبیوتیک، مدت‌زمان استفاده مناسب، دوز و روش مصرف صحیح است. همچنین، استفاده غیرضروری یا نادرست از آنتی‌بیوتیک‌ها باید به حداقل رسانده شود تا مقاومت آنتی‌بیوتیکی در بین باکتری‌ها کاهش یابد. از طرف دیگر، ضروری است که سیستم نظارت مداوم و برنامه‌های شدید کنترل عفونت بیمارستانی برای جلوگیری از انتشار بیشتر در مراکز درمانی و جامعه به کار گرفته شود. برای این منظور، ارائه آموزش به کارکنان بهداشتی و پرستاران درباره خطرات و روش‌های پیشگیری از عفونت‌های سویههای به شدت بیماری‌زای کلبسیلا پنومونیه حائز اهمیت است. آموزش‌ها شامل استفاده صحیح از ضدعفونی کننده‌ها، بهداشت دست، مدیریت صحیح عفونت و روش‌های پیشگیری در بستر بیمارستان است. علاوه بر آموزش، کنترل عفونت‌های بیمارستانی نیز باید به‌طور جدی پیگیری شود. اتخاذ تدابیر مناسب برای کنترل و پیشگیری از عفونت‌های بیمارستانی در بخش‌های مختلف، از جمله عفونت‌های ناشی از کلبسیلا پنومونیه، از اهمیت ویژه‌ای برخوردار است. با همکاری تیم‌های بهداشتی و مدیریتی بیمارستان، پزشکان و کادر درمانی، می‌توان به عنوانی شیوع سویههای هایپر ویرولانت کلبسیلا پنومونیه را کاهش داد و محیطی ایمن‌تر را برای بیماران فراهم کرد.
ملاحظات اخلاقی
این مطالعه با شناسه اخلاق [IR.GUMS.REC.1398.297] در سامانه اخلاق پژوهشهای زیستی علوم پزشکی گیلان تصویب شد.
حمایت مالی
این مطالعه تحت حمایت مالی هیچ سازمان و موسسه‌ای نبوده است.
تعارض منافع
هیچ تعارض منافعی توسط نویسندگان اعلام نشد.
تشکر و قدردانی
نویسندگان این مقاله کمال تشکر را از تمامی کادر درمان بیمارستان جهت همکاری در این مطالعه را دارند.
نوع مطالعه: پژوهشي(توصیفی- تحلیلی) |
موضوع مقاله:
میکروبیولوژی
فهرست منابع
1. Calfee DP. Recent advances in the understanding and management of Klebsiella pneumoniae. F1000Res 2017;6:1760. [DOI:10.12688/f1000research.11532.1] [PMID] []
2. Paczosa MK, Mecsas J. Klebsiella pneumoniae: Going on the Offense with a Strong Defense. Microbiol Mol Biol Rev 2016;80(3):629-61.
https://doi.org/10.1128/MMBR.00078-15 [DOI:10.1128/mmbr.00078-15] [PMID] []
3. Mohd Asri NA, Ahmad S, Mohamud R, Mohd Hanafi N, Mohd Zaidi NF, Irekeola AA, et al. Global Prevalence of Nosocomial Multidrug-Resistant Klebsiella pneumoniae: A Systematic Review and Meta-Analysis. Antibiotics (Basel) 2021;10(12). [DOI:10.3390/antibiotics10121508] [PMID] []
4. Meatherall BL, Gregson D, Ross T, Pitout JD, Laupland KB. Incidence, risk factors, and outcomes of Klebsiella pneumoniae bacteremia. Am J Med 2009;122(9):866-73. [DOI:10.1016/j.amjmed.2009.03.034] [PMID]
5. Chang D, Sharma L, Dela Cruz CS, Zhang D. Clinical Epidemiology, Risk Factors, and Control Strategies of Klebsiella pneumoniae Infection. Front Microbiol 2021;12:750662. [DOI:10.3389/fmicb.2021.750662] [PMID] []
6. Karami-Zarandi M, Rahdar HA, Esmaeili H, Ranjbar R. Klebsiella pneumoniae: an update on antibiotic resistance mechanisms. Future Microbiol 2023;18:65-81. [DOI:10.2217/fmb-2022-0097] [PMID]
7. Samir A, Abdel-Moein KA, Zaher HM. The Public Health Burden of Virulent Extended-Spectrum β-Lactamase-Producing Klebsiella pneumoniae Strains Isolated from Diseased Horses. Vector Borne Zoonotic Dis 2022;22(4):217-24. [DOI:10.1089/vbz.2022.0004] [PMID]
8. Jiang W, Yang W, Zhao X, Wang N, Ren H. Klebsiella pneumoniae presents antimicrobial drug resistance for β-lactam through the ESBL/PBP signaling pathway. Exp Ther Med 2020;19(4):2449-56. [DOI:10.3892/etm.2020.8498]
9. Elmanakhly AR, Bendary MM, Safwat NA, Awad EA, Alhomrani M, Alamri AS, et al. Carbapenem-Resistant Klebsiella pneumoniae: Diversity, Virulence, and Antimicrobial Resistance. Infect Drug Resist 2022;15:6177-87.
https://doi.org/10.2147/IDR.S387742 [DOI:10.2147/idr.s387742] [PMID] []
10. Russo TA, Marr CM. Hypervirulent Klebsiella pneumoniae. Clin Microbiol Rev 2019;32(3).
https://doi.org/10.1128/CMR.00001-19 [DOI:10.1128/cmr.00001-19] [PMID] []
11. Choby JE, Howard-Anderson J, Weiss DS. Hypervirulent Klebsiella pneumoniae - clinical and molecular perspectives. J Intern Med 2020;287(3):283-300. [DOI:10.1111/joim.13007] [PMID] []
12. Yu F, Lv J, Niu S, Du H, Tang YW, Pitout JDD, et al. Multiplex PCR Analysis for Rapid Detection of Klebsiella pneumoniae Carbapenem-Resistant (Sequence Type 258 [ST258] and ST11) and Hypervirulent (ST23, ST65, ST86, and ST375) Strains. J Clin Microbiol 2018;56(9).
https://doi.org/10.1128/JCM.00731-18 [DOI:10.1128/jcm.00731-18] [PMID] []
13. Chang CY, Ong ELC. Positive string test in hypervirulent Klebsiella pneumoniae liver abscess. Oxf Med Case Reports 2022;2022(4):omac035. [DOI:10.1093/omcr/omac035] [PMID] []
14. Wayne PA. Performance Standards for Antimicrobial Susceptibility Testing. Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI) 2022;32th Informational Supplement. (M100-S28). [URL]
15. Nobari S, Shahcheraghi F, Rahmati Ghezelgeh F, Valizadeh B. Molecular characterization of carbapenem-resistant strains of Klebsiella pneumoniae isolated from Iranian patients: first identification of blaKPC gene in Iran. Microb Drug Resist 2014;20(4):285-93. [DOI:10.1089/mdr.2013.0074] [PMID]
16. Nordmann P, Poirel L, Carrër A, Toleman MA, Walsh TR. How to detect NDM-1 producers. J Clin Microbiol 2011;49(2):718-21.
https://doi.org/10.1128/JCM.01773-10 [DOI:10.1128/jcm.01773-10] [PMID] []
17. Marr CM, Russo TA. Hypervirulent Klebsiella pneumoniae: a new public health threat. Expert Rev Anti Infect Ther 2019;17(2):71-3. [DOI:10.1080/14787210.2019.1555470] [PMID] []
18. Rastegar S, Moradi M, Kalantar-Neyestanaki D, Ali Golabi D, Hosseini-Nave H. Virulence Factors, Capsular Serotypes and Antimicrobial Resistance of Hypervirulent Klebsiella pneumoniae and Classical Klebsiella pneumoniae in Southeast Iran. Infect Chemother 2019. [DOI:10.3947/ic.2019.0027] [PMID]
19. Shoja S, Ansari M, Bengar S, Rafiei A, Shamseddin J, Alizade H. Bacteriological characteristics of hypervirulent Klebsiella pneumoniae rmpA gene (hvKp-rmpA)-harboring strains in the south of Iran. Iran J Microbiol 2022;14(4):475-83. [DOI:10.18502/ijm.v14i4.10233] [PMID] []
20. Mohammad Ali Tabrizi A, Badmasti F, Shahcheraghi F, Azizi O. Outbreak of hypervirulent Klebsiella pneumoniae harbouring bla(VIM-2) among mechanically-ventilated drug-poisoning patients with high mortality rate in Iran. J Glob Antimicrob Resist 2018;15:93-8. [DOI:10.1016/j.jgar.2018.06.020] [PMID]
21. Taraghian A, Nasr Esfahani B, Moghim S, Fazeli H. Characterization of Hypervirulent Extended-Spectrum β-Lactamase-Producing Klebsiella pneumoniae Among Urinary Tract Infections: The First Report from Iran. Infect Drug Resist 2020;13:3103-11.
https://doi.org/10.2147/IDR.S264440 [DOI:10.2147/idr.s264440] [PMID] []
22. Sanikhani R, Moeinirad M, Solgi H, Hadadi A, Shahcheraghi F, Badmasti F. The face of hypervirulent Klebsiella pneumoniae isolated from clinical samples of two Iranian teaching hospitals. Ann Clin Microbiol Antimicrob 2021;20(1):58. [DOI:10.1186/s12941-021-00467-2] [PMID] []
23. Sanikhani R, Moeinirad M, Shahcheraghi F, Lari A, Fereshteh S, Sepehr A, et al. Molecular epidemiology of hypervirulent Klebsiella pneumoniae: a systematic review and meta-analysis. Iran J Microbiol 2021;13(3):257-65. [DOI:10.18502/ijm.v13i3.6384] [PMID] []
24. Rafat C, Messika J, Barnaud G, Dufour N, Magdoud F, Billard-Pomarès T, et al. Hypervirulent Klebsiella pneumoniae, a 5-year study in a French ICU. J Med Microbiol 2018;67(8):1083-9. [DOI:10.1099/jmm.0.000788] [PMID]
25. Zhang Y, Ma Y, Ye L, Luo Y, Yang J. Prevalence and Antimicrobial Susceptibility of Hypervirulent Klebsiella pneumoniae isolates in China. Clin Infect Dis 2014;58(10):1493-4. [DOI:10.1093/cid/ciu110] [PMID]
26. Jian-Li W, Yuan-Yuan S, Shou-Yu G, Fei-Fei D, Jia-Yu Y, Xue-Hua W, et al. Serotype and virulence genes of Klebsiella pneumoniae isolated from mink and its pathogenesis in mice and mink. Sci Rep 2017;7(1):17291. [DOI:10.1038/s41598-017-17681-8] [PMID] []
27. Zhao J, Liu C, Liu Y, Zhang Y, Xiong Z, Fan Y, et al. Genomic characteristics of clinically important ST11 Klebsiella pneumoniae strains worldwide. J Glob Antimicrob Resist 2020;22:519-26. [DOI:10.1016/j.jgar.2020.03.023] [PMID]
28. Farhadi M, Ahanjan M, Goli HR, Haghshenas MR, Gholami M. High frequency of multidrug-resistant (MDR) Klebsiella pneumoniae harboring several β-lactamase and integron genes collected from several hospitals in the north of Iran. Ann Clin Microbiol Antimicrob 2021;20(1):70. [DOI:10.1186/s12941-021-00476-1] [PMID] []
29. Turner KM, Hanage WP, Fraser C, Connor TR, Spratt BG. Assessing the reliability of eBURST using simulated populations with known ancestry. BMC Microbiol 2007;7:30. [DOI:10.1186/1471-2180-7-30] [PMID] []
30. Sohrabi M, Alizade Naini M, Rasekhi A, Oloomi M, Moradhaseli F, Ayoub A, et al. Emergence of K1 ST23 and K2 ST65 hypervirulent klebsiella pneumoniae as true pathogens with specific virulence genes in cryptogenic pyogenic liver abscesses Shiraz Iran. Front Cell Infect Microbiol 2022;12:964290. [DOI:10.3389/fcimb.2022.964290] [PMID] []
31. Roulston KJ, Bharucha T, Turton JF, Hopkins KL, Mack DJF. A case of NDM-carbapenemase-producing hypervirulent Klebsiella pneumoniae sequence type 23 from the UK. JMM Case Rep 2018;5(9):e005130. [DOI:10.1099/jmmcr.0.005130] [PMID] []
ارسال پیام به نویسنده مسئول
| بازنشر اطلاعات | |
 |
این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است. |
