دوره 34، شماره 7 - ( مهر 1402 )
جلد 34 شماره 7 صفحات 407-397 |
برگشت به فهرست نسخه ها
Ethics code: IR.GUMS.REC.1401.406
Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
Zeinali T, Faraji N, Joukar F, Maroufizadeh S, Shenagari M, Naghipour M et al . ASSOCIATION BETWEEN CYCLE THRESHOLD (CT) AND CLINICAL OUTCOMES IN PATIENTS WITH COVID-19. Studies in Medical Sciences 2023; 34 (7) :397-407
URL: http://umj.umsu.ac.ir/article-1-6035-fa.html
URL: http://umj.umsu.ac.ir/article-1-6035-fa.html
زینلی طاهره، فرجی نیلوفر، جوکار فرحناز، معروفی‌زاد سامان، شناگری محمد، نقی پور محمدرضا و همکاران.. ارتباط بین مقادیر آستانه چرخه (Ct) و پیامدهای بالینی در بیماران مبتلا به کووید-19. مجله مطالعات علوم پزشکی. 1402; 34 (7) :397-407
طاهره زینلی 
، نیلوفر فرجی ، فرحناز جوکار ، سامان معروفی‌زاد ، محمد شناگری ، محمدرضا نقی پور ، فریبرز منصور قناعی*
، نیلوفر فرجی ، فرحناز جوکار ، سامان معروفی‌زاد ، محمد شناگری ، محمدرضا نقی پور ، فریبرز منصور قناعی*
استاد بیماری‌های گوارش و کبد بالغین، مرکز تحقیقات بیماری‌های گوارش و کبد گیلان، دانشگاه علوم پزشکی گیلان، رشت، ایران (نویسنده مسئول) ، fmansourghanaei@gmail.com
چکیده: (205 مشاهده)
پیش‌زمینه و هدف: داشتن آگاهی درست از تشخیص‌های آزمایشگاهی مثل ارتباط بین مقدار آستانه چرخه (Ct Value)ویا میزان بار ویروس SARS-CoV-2 می‌تواند بعنوان یک عامل پیش‌بینی کننده از خطر عفونت سویه های جدید ویروس SARS-CoV-2 برای بیماران مبتلا به کووید-19 به کار رود. این مطالعه بر اساس این فرضیه که مقدار Ct ویروس SARS-CoV-2 می‌تواند به‌عنوان یک بیومارکر از شدت بیماری، پیامد بالینی و مرگ‌و‌میر بیماران عمل کند، انجام شد.
مواد و روش کار: در این مطالعه تحلیلی، نتایج تست qRT-PCR ویروس SARS-COV-2، 443 بیمار بستری در بیمارستان های دولتی شهرستان رشت در طی سال1400-1399 بررسی شد و سپس، ارتباط بین وضعیت Ct بیماران با بار ویروسی بالا (25 ≥Ct) و با بار ویروسی پایین )25 <Ct) با مشخصات دموگرافیک و بالینی تعیین گردید.
یافته‌ها: مقادیرCt در بیماران فوتی نسبت به بیماران ترخیص شده، به‌صورت معناداری پایین‌تر بود (005/0=P)؛ هم‌چنین مقادیرCt در بیمارانی که در ICU بستری شده بودند، به‌صورت معناداری پایین‌تر از بیمارانی بود که در بخش‌های کنترل عفونت بستری شده بودند (002/0=P). بر اساس نتایج تحلیلی تعدیل‌شده، داشتن بار ویروس زیاد (25 ≥Ct) شانس فوت درون‌بیمارستانی (28/11 – 36/2 :CI 95%, 16/5=OR) و بستری در ICU درون‌بیمارستانی (28/11 – 36/2 :CI 95%, 87/6=OR) را افزایش می‌دهد.
بحث و نتیجه‌گیری: در بیماران بستری شده با کووید-19، بار ویروسیSARS-CoV-2 با مرگ‌و‌میر و بستری در بخش ICU ارتباط داشت. این
یافته‌ها نشان می‌دهد که مقدار Ct می تواند به‌عنوان ابزاری برای کمک به شناسایی بیمارانی که در معرض خطر بیشتری برای پیامدهای شدید بیماری کووید-19 هستند، استفاده شود.
مواد و روش کار: در این مطالعه تحلیلی، نتایج تست qRT-PCR ویروس SARS-COV-2، 443 بیمار بستری در بیمارستان های دولتی شهرستان رشت در طی سال1400-1399 بررسی شد و سپس، ارتباط بین وضعیت Ct بیماران با بار ویروسی بالا (25 ≥Ct) و با بار ویروسی پایین )25 <Ct) با مشخصات دموگرافیک و بالینی تعیین گردید.
یافته‌ها: مقادیرCt در بیماران فوتی نسبت به بیماران ترخیص شده، به‌صورت معناداری پایین‌تر بود (005/0=P)؛ هم‌چنین مقادیرCt در بیمارانی که در ICU بستری شده بودند، به‌صورت معناداری پایین‌تر از بیمارانی بود که در بخش‌های کنترل عفونت بستری شده بودند (002/0=P). بر اساس نتایج تحلیلی تعدیل‌شده، داشتن بار ویروس زیاد (25 ≥Ct) شانس فوت درون‌بیمارستانی (28/11 – 36/2 :CI 95%, 16/5=OR) و بستری در ICU درون‌بیمارستانی (28/11 – 36/2 :CI 95%, 87/6=OR) را افزایش می‌دهد.
بحث و نتیجه‌گیری: در بیماران بستری شده با کووید-19، بار ویروسیSARS-CoV-2 با مرگ‌و‌میر و بستری در بخش ICU ارتباط داشت. این
یافته‌ها نشان می‌دهد که مقدار Ct می تواند به‌عنوان ابزاری برای کمک به شناسایی بیمارانی که در معرض خطر بیشتری برای پیامدهای شدید بیماری کووید-19 هستند، استفاده شود.
نوع مطالعه: پژوهشي(توصیفی- تحلیلی) |
موضوع مقاله:
ویروس شناسی
فهرست منابع
1. Yuen KS, Ye ZW, Fung SY, Cheung PH, Chan CP, Jin DY. SARS-CoV-2 and COVID-19: revisiting the most important research questions. Cell Biosci 2021;11(1):215.10.1186/s13578-021-00730-1 2. Deming ME, Chen WH. COVID-19 and Lessons to Be Learned from Prior Coronavirus Outbreaks. Ann Am Thorac Soc 2020;17(7):790-4. 10.1513/AnnalsATS.202002-149PS
10.1513/AnnalsATS.202002-149PS [] [PMID] [PMCID]
2. Al-Tawfiq JA, Leonardi R, Fasoli G, Rigamonti D. Prevalence and fatality rates of COVID-19: What are the reasons for the wide variations worldwide? Travel Med Infect Dis 2020;35:101711. [DOI:10.1016/j.tmaid.2020.101711] [PMID] [PMCID]
3. Choudhuri J, Carter J, Nelson R, Skalina K, Osterbur-Badhey M, Johnston A, et al. SARS-CoV-2 PCR cycle threshold at hospital admission associated with patient mortality. PloS One 2020;15(12):e0244777. [DOI:10.1371/journal.pone.0244777] [PMID] [PMCID]
4. Shah VP, Farah WH, Hill JC, Hassett LC, Binnicker MJ, Yao JD, et al. Association Between SARS-CoV-2 Cycle Threshold Values and Clinical Outcomes in Patients With COVID-19: A Systematic Review and Meta-analysis. Open Forum Infect Dis 2021;8(9):ofab453. [DOI:10.1093/ofid/ofab453] [PMID] [PMCID]
5. Roquebert B, Haim-Boukobza S, Trombert-Paolantoni S, Lecorche E, Verdurme L, Foulongne V, et al. SARS-CoV-2 variants of concern are associated with lower RT-PCR amplification cycles between January and March 2021 in France. Int J Infect Dis 2021;113:12-4. [DOI:10.1016/j.ijid.2021.09.076] [PMID] [PMCID]
6. Singh J, Pandit P, McArthur AG, Banerjee A, Mossman K. Evolutionary trajectory of SARS-CoV-2 and emerging variants. Virol J 2021;18(1):166. [DOI:10.1186/s12985-021-01633-w] [PMID] [PMCID]
7. Laitman AM, Lieberman JA, Hoffman NG, Roychoudhury P, Mathias PC, Greninger AL. The SARS-CoV-2 Omicron Variant Does Not Have Higher Nasal Viral Loads Compared to the Delta Variant in Symptomatic and Asymptomatic Individuals. J Clin Microbiol 2022;60(4):e0013922. [DOI:10.1128/jcm.00139-22] [PMID] [PMCID]
8. Amini N, Mahdavi M, Choubdar H, Abedini A, Shalbaf A, Lashgari R. Automated prediction of COVID-19 mortality outcome using clinical and laboratory data based on hierarchical feature selection and random forest classifier. Comput Methods Biomech Biomed Engin 2023;26(2):160-73. [DOI:10.1080/10255842.2022.2050906] [PMID]
9. Shalbaf A, Amini N, Choubdar H, Mahdavi M, Abedini A, Lashgari R. Early prediction of COVID-19 mortality risk based on demographic, vital sign and blood test. Tehran Univ Med J 2022;79(12):934-42. [Google Scholar]
10. Engstrom-Melnyk J, Rodriguez PL, Peraud O, Hein RC. Clinical applications of quantitative real-time PCR in virology. Methods in Microbiology. 42: Elsevier; 2015. p. 161-97. [DOI:10.1016/bs.mim.2015.04.005] [PMCID]
11. Watzinger F, Ebner K, Lion T. Detection and monitoring of virus infections by real-time PCR. Mol Aspects Med 2006;27(2-3):254-98. [DOI:10.1016/j.mam.2005.12.001] [PMID] [PMCID]
12. Waudby-West R, Parcell BJ, Palmer CNA, Bell S, Chalmers JD, Siddiqui MK. The association between SARS-CoV-2 RT-PCR cycle threshold and mortality in a community cohort. Eur Respir J 2021;58(1). [DOI:10.1183/13993003.00360-2021] [PMID] [PMCID]
13. Ade C, Pum J, Abele I, Raggub L, Bockmühl D, Zöllner B. Analysis of cycle threshold values in SARS-CoV-2-PCR in a long-term study. J Clin Virol 2021;138:104791. [DOI:10.1016/j.jcv.2021.104791] [PMID] [PMCID]
14. Magleby R, Westblade LF, Trzebucki A, Simon MS, Rajan M, Park J, et al. Impact of Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 Viral Load on Risk of Intubation and Mortality Among Hospitalized Patients With Coronavirus Disease 2019. Clin Infect Dis 2021;73(11):e4197-e205. [DOI:10.1093/cid/ciaa851] [PMID] [PMCID]
15. Argyropoulos KV, Serrano A, Hu J, Black M, Feng X, Shen G, et al. Association of Initial Viral Load in Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 (SARS-CoV-2) Patients with Outcome and Symptoms. Am J Pathol 2020;190(9):1881-7. [DOI:10.1016/j.ajpath.2020.07.001] [PMID] [PMCID]
16. To KK, Tsang OT, Leung WS, Tam AR, Wu TC, Lung DC, et al. Temporal profiles of viral load in posterior oropharyngeal saliva samples and serum antibody responses during infection by SARS-CoV-2: an observational cohort study. Lancet Infect Dis 2020;20(5):565-74. [DOI:10.1016/S1473-3099(20)30196-1] [PMID]
17. Bakir A, Hosbul T, Cuce F, Artuk C, Taskin G, Caglayan M, et al. Investigation of Viral Load Cycle Threshold Values in Patients with SARS-CoV-2 Associated Pneumonia with Real-Time PCR Method. J Infect Dev Ctries 2021;15(10):1408-14. [DOI:10.3855/jidc.14281] [PMID]
18. Mohieldin Mahgoub Ibrahim M, Colucci ME, Veronesi L, Viani I, Odone A, Arena MP, et al. Virological surveillance of SARS-CoV-2 in an Italian Northern area: differences in gender, age and Real Time RT PCR cycle threshold (Ct) values in three epidemic periods. Acta Biomed 2021;92(S6):e2021457. [PMID]
19. Zacharioudakis IM, Zervou FN, Prasad PJ, Shao Y, Basu A, Inglima K, et al. Association of SARS-CoV-2 genomic load trends with clinical status in COVID-19: A retrospective analysis from an academic hospital center in New York City. PLoS One 2020;15(11):e0242399. [DOI:10.1371/journal.pone.0242399] [PMID] [PMCID]
20. Hay JA, Kissler SM, Fauver JR, Mack C, Tai CG, Samant RM, et al. Viral dynamics and duration of PCR positivity of the SARS-CoV-2 Omicron variant. MedRxiv 2022:2022.01. [URL]
21. Abu-Raddad LJ, Chemaitelly H, Ayoub HH, Tang P, Coyle P, Hasan MR, et al. Relative infectiousness of SARS-CoV-2 vaccine breakthrough infections, reinfections, and primary infections. Nat Commun 2022;13(1):532. [DOI:10.1038/s41467-022-28199-7] [PMID] [PMCID]
22. Saglik I, Ener B, Akalin H, Ozdemir B, Ocakoglu G, Yalcin B, et al. Association of SARS-CoV-2 cycle threshold (Ct) values with clinical course and serum biomarkers in COVID-19 patients. J Infect Dev Ctries 2022;16(03):445-52. [DOI:10.3855/jidc.15818] [PMID]
23. Zheng S, Fan J, Yu F, Feng B, Lou B, Zou Q, et al. Viral load dynamics and disease severity in patients infected with SARS-CoV-2 in Zhejiang province, China, January-March 2020: retrospective cohort study. BMJ 2020;369:m1443. [DOI:10.1136/bmj.m1443] [PMID] [PMCID]
24. Xu T, Chen C, Zhu Z, Cui M, Chen C, Dai H, et al. Clinical features and dynamics of viral load in imported and non-imported patients with COVID-19. Int J Infect Dis 2020;94:68-71. [DOI:10.1016/j.ijid.2020.03.022] [PMID] [PMCID]
25. Fajnzylber J, Regan J, Coxen K, Corry H, Wong C, Rosenthal A, et al. SARS-CoV-2 viral load is associated with increased disease severity and mortality. Nat Commun 2020;11(1):5493. [DOI:10.1038/s41467-020-19057-5] [PMID] [PMCID]
26. Ashrafi S, Pourahmad Kisomi P, Maroufizadeh S, Jabbari MR, Nafar M, Samavat S, et al. The relationship between CT value and clinical outcomes in renal patients with COVID-19. Int Urol Nephrol 2022:1-13. [DOI:10.1007/s11255-022-03318-x] [PMID] [PMCID]
27. Zacharioudakis IM, Prasad PJ, Zervou FN, Basu A, Inglima K, Weisenberg SA, et al. Association of SARS-CoV-2 Genomic Load with Outcomes in Patients with COVID-19. Ann Am Thorac Soc 2021;18(5):900-3. [DOI:10.1513/AnnalsATS.202008-931RL] [PMID] [PMCID]
28. Westblade LF, Brar G, Pinheiro LC, Paidoussis D, Rajan M, Martin P, et al. SARS-CoV-2 viral load predicts mortality in patients with and without cancer who are hospitalized with COVID-19. Cancer Cell 2020;38(5):661-71. e2. [DOI:10.1016/j.ccell.2020.09.007] [PMID] [PMCID]
29. Yu X, Sun S, Shi Y, Wang H, Zhao R, Sheng J. SARS-CoV-2 viral load in sputum correlates with risk of COVID-19 progression. Crit Care 2020;24(1):170. [DOI:10.1186/s13054-020-02893-8] [PMID] [PMCID]
30. Yagci AK, Sarinoglu RC, Bilgin H, Yanılmaz Ö, Sayın E, Deniz G, et al. Relationship of the cycle threshold values of SARS-CoV-2 polymerase chain reaction and total severity score of computerized tomography in patients with COVID 19. Int J Infect Dis 2020;101:160-6. [DOI:10.1016/j.ijid.2020.09.1449] [PMID] [PMCID]
31. Rajyalakshmi B, Samavedam S, Reddy PR, Aluru N. Prognostic Value of "Cycle Threshold" in Confirmed COVID-19 Patients. Indian J Crit Care Med 2021;25(3):322-6. [DOI:10.5005/jp-journals-10071-23765] [PMID] [PMCID]
32. Atique M, Ghafoor A, Javed R, Fatima N, Yousaf A, Zahra S. Correlation of Viral Load With the Clinical and Biochemical Profiles of COVID-19 Patients. Cureus 2021;13(7):e16655. [Google Scholar]
33. Zou L, Ruan F, Huang M, Liang L, Huang H, Hong Z, et al. SARS-CoV-2 Viral Load in Upper Respiratory Specimens of Infected Patients. N Engl J Med 2020;382(12):1177-9. [DOI:10.1056/NEJMc2001737] [PMID] [PMCID]
34. Demichev V, Tober-Lau P, Nazarenko T, Lemke O, Kaur Aulakh S, Whitwell HJ, et al. A proteomic survival predictor for COVID-19 patients in intensive care. PLOS Digital Health 2022;1(1):e0000007. [DOI:10.1371/journal.pdig.0000007] [PMID] [PMCID]
35. Khanna VV, Chadaga K, Sampathila N, Prabhu S, Chadaga R, Umakanth S. Diagnosing COVID-19 using artificial intelligence: A comprehensive review. Netw Model Anal Health Inform Bioinform 2022;11(1):25. [DOI:10.1007/s13721-022-00367-1]
36.
ارسال پیام به نویسنده مسئول
| بازنشر اطلاعات | |
 |
این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است. |
