<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Studies in Medical Sciences</title>
<title_fa>مجله مطالعات علوم پزشکی</title_fa>
<short_title>Studies in Medical Sciences</short_title>
<subject>Medical Sciences</subject>
<web_url>http://umj.umsu.ac.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>37</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>journal37</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>2717-008X</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2717-008X</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii></journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.61882/umj</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid></journal_id_sid>
<journal_id_nlai></journal_id_nlai>
<journal_id_science></journal_id_science>
<language>en</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1395</year>
	<month>11</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2017</year>
	<month>2</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>27</volume>
<number>11</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>شناسایی ژنهای ویرولانس در سویه های اشریشیا کلی  جدا شده از کودکان مبتلا به عفونت دستگاه ادراری و تعیین مقاومت آنتی‌بیوتیکی آنها</title_fa>
	<title>Detection of virulence genes in Escherichia coli strains isolated from pediatric with urinary tract infection and their antibiotic resistance profile</title>
	<subject_fa>میکروبیولوژی</subject_fa>
	<subject>میکروبیولوژی</subject>
	<content_type_fa>پژوهشي(توصیفی- تحلیلی)</content_type_fa>
	<content_type>Research</content_type>
	<abstract_fa>&lt;p dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;strong&gt;پیشرمینه و هدف:&lt;/strong&gt; عفونت های دستگاه ادراری&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt; (UTI) &lt;/span&gt;یکی از شایعترین عفونتهای سراسر جهان هستند. مبتلایان به عفونت ادراری اشرشیاکلی&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt; (UPEC)&lt;/span&gt; پاتوژن اولیه ای که باعث عفونت ادراری می شوند. هدف از انجام این مطالعه شناسایی ژنهای مختلف &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;papC&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;، &amp;nbsp;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;papG&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;، &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;fimH&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; ، &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;iutA&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; ، &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;sfaS&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; ، &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;ibeA&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; و نیز بررسی میزان حساسیت آنتی&amp;shy;بیوتیکی ایزوله های &amp;nbsp;&lt;em&gt;اشریشیاکلی&lt;/em&gt; جدا شده از نمونه ادراری می باشد.&amp;nbsp;&lt;/p&gt;

&lt;p dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;strong&gt;مواد و روش کار: &lt;/strong&gt;در این تحقیق توصیفی- مقطعی، 120 نمونه از کودکان مبتلا به عفونت دستگاه ادراری مراجعه کننده به مرکز طبی کودکان در تهران جمع&#8204;آوری و پس از جداسازی باکتری و استخراج &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;DNA&lt;/span&gt;، آزمون های حساسیت آنتی بیوتیکی توسط روش دیسک دیفیوژن با آنتی بیوتیک&amp;shy;های مورد نظر انجام گرفت. حضور ژن&#8204;های کلاس&#8204; &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;papC&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;، &amp;nbsp;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;papG&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;، &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;fimH&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; ، &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;iutA&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; ، &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;sfaS&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&amp;nbsp; و &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;ibeA&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; به روش &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;PCR&lt;/span&gt; چندگانه&amp;shy;ای مورد بررسی قرار گرفت.&lt;/p&gt;

&lt;p dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;strong&gt;یافته ها&#8204;: &lt;/strong&gt;نتایج نشان داد که نمونه&amp;shy;های &lt;em&gt;اشریشیاکلی&lt;/em&gt; جدا شده نسبت به آمیکاسین (100 درصد) حساس و نسبت به آمپی&amp;shy;سیلین (60 درصد) مقاومت داشته&amp;shy;اند. فراوانی ژنهای تحت مطالعه &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;papC&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; (58%)، &amp;nbsp;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;papG&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;(47%)،&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;fimH&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; (85%)، &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;iutA&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; (35%)، &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;sfaS&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; (1%) &amp;nbsp;و &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;ibeA&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; (1%) بود&lt;em&gt;. &lt;/em&gt;&lt;/p&gt;

&lt;p dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;strong&gt;بحث و نتیجه&#8204;گیری:&lt;/strong&gt; نتایج این مطالعه نشان داد که ژن &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;fimH&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; &amp;nbsp;و ژن &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;papC&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; شایع&#8204;ترین ژن های شناسایی شده در &lt;em&gt;اشریشیاکلی&#8204;&lt;/em&gt; جدا شده از عفونت دستگاه ادراری بوده است. علت تفاوت نتایج با سایر مطالعات به دلیل تنوع منطقه جغرافیایی می&amp;shy;باشد.&lt;/p&gt;
</abstract_fa>
	<abstract>&lt;p&gt;&lt;strong&gt;&lt;em&gt;Background:&lt;/em&gt;&lt;/strong&gt; Urinary tract infections (UTI) are one of the most common infections worldwide. Uropathogenic &lt;em&gt;Escherichia coli&lt;/em&gt; (UPEC), which causes urinary tract infections are the primary pathogens. The aim of this study is to identify different genes &lt;em&gt;papC, papG, fimH, iutA, sfaS, ibeA&lt;/em&gt; and antibiotic susceptibility of E. coli strains isolated from urinary tract infection.&lt;/p&gt;

&lt;p&gt;&lt;strong&gt;&lt;em&gt;Methods&lt;/em&gt;&lt;/strong&gt;&lt;em&gt;:&lt;/em&gt; In this study cross-sectional, 120 samples were collected from patients with urinary tract infection referred to children medical Center in Tehran, Iran. Antibiotic susceptibility testing by disk diffusion method was performed according to CLSI guidelines. Thus, &amp;nbsp;DNA extraction was performed from all strains and &amp;nbsp;multiplex PCR was conducted for detection &lt;em&gt;papC, papG, fimH, iutA, sfaS and ibeA&lt;/em&gt; virulance genes in all strains.&lt;/p&gt;

&lt;p&gt;&lt;strong&gt;&lt;em&gt;Results: &lt;/em&gt;&lt;/strong&gt;&amp;nbsp;The results showed that &lt;em&gt;E.coli&lt;/em&gt; isolates to amikacin (100%) sensitive and had resistance to ampicillin (60%). Virulence genes prevalence was &lt;em&gt;fimH&lt;/em&gt; 85%, &lt;em&gt;papC&lt;/em&gt; 58%, &lt;em&gt;papG&lt;/em&gt; 47%, &lt;em&gt;iutA&lt;/em&gt; 35%, &lt;em&gt;sfaS&lt;/em&gt; 1% and &lt;em&gt;ibeA &lt;/em&gt;1&lt;em&gt;%.&lt;/em&gt;&lt;/p&gt;

&lt;p&gt;&lt;strong&gt;&lt;em&gt;Conclusion:&lt;/em&gt;&lt;/strong&gt; The results of this study showed that the most common gene encoding genes &lt;em&gt;fimH&lt;/em&gt; and &lt;em&gt;papC&lt;/em&gt; adhesion genes in &lt;em&gt;E.coli&lt;/em&gt; was isolated from urinary tract infection Fimbriae pap. The difference between the results with other studies due to the diversity of geographic region.&lt;/p&gt;
</abstract>
	<keyword_fa>اشریشیا کلی, ژنهای ویرولانس, کودکان, عفونت دستگاه ادراری, مقاومت آنتی‌بیوتیکی.</keyword_fa>
	<keyword>Escherichia coli, virulence genes, pediatric, urinary tract infection, antibiotic resistance.</keyword>
	<start_page>942</start_page>
	<end_page>949</end_page>
	<web_url>http://umj.umsu.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-1848-3&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Mitra</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Alishah</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>میترا</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>علیشاه</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>alm3370@yahoo.com</email>
	<code>3700319475328460017155</code>
	<orcid>3700319475328460017155</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Microbiology, School of Basic Sciences, Saveh Branch, Islamic Azad University, Saveh, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه میکروبیولوژی، دانشکده علوم پایه، واحد ساوه، دانشگاه آزاد اسلامی، ساوه، ایران.</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Kumarss</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Amini</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>کیومرث</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>امینی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>tsalehi@ut.ac.ir</email>
	<code>3700319475328460017156</code>
	<orcid>3700319475328460017156</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>Department of Microbiology, School of Basic Sciences, Saveh Branch, Islamic Azad University, Saveh, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه میکروبیولوژی، دانشکده علوم پایه، واحد ساوه، دانشگاه آزاد اسلامی، ساوه، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Taghi</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Zahraei Salehi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>تقی</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>زهرایی صالح</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>dr_kumarss_amini@yahoo.com</email>
	<code>3700319475328460017157</code>
	<orcid>3700319475328460017157</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Microbiology Department, Faculty of Specialize Veterinary Medicine, Science and Research Branch, Islamic Azad University, Tehran, Iran </affiliation>
	<affiliation_fa>گروه میکروبیولوژی، دانشکده علوم تخصصی دامپزشکی، واحد علوم و تحقیقات، دانشگاه آزاد اسلامی، تهران، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
