دوره 31، شماره 1 - ( فروردین 1399 )
جلد 31 شماره 1 صفحات 74-66 |
برگشت به فهرست نسخه ها
Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
Rajabi A, Emami A, Safaralizadeh R. EVALUATION OF ELTD1 GENE EXPRESSION IN MELATONIN-TREATED HT29 CANCER CELLS: AN EXPERIMENTAL BIOINFORMATICS STUDY. Studies in Medical Sciences 2020; 31 (1) :66-74
URL: http://umj.umsu.ac.ir/article-1-5011-fa.html
URL: http://umj.umsu.ac.ir/article-1-5011-fa.html
رجبی علی، امامی علی، صفرعلیزاده رضا. بررسی میزان بیان ژن ELTD1 در سلول‌های سرطانی HT29 تیمار شده با ملاتونین: مطالعه بیوانفورماتیکی و تجربی. مجله مطالعات علوم پزشکی. 1399; 31 (1) :66-74
دانشیار گروه ژنتیک، دانشکده علوم طبیعی، دانشگاه تبریز، تبریز، ایران (نویسنده مسئول) ، safaralizadeh@tabrizu.ac.ir
چکیده: (2619 مشاهده)
پیش‌زمینه و هدف: سرطان کلورکتال بعد از سرطانهای ریه و پستان بیشترین میزان مرگ‌ومیر را در بین سرطان‌ها دارد. ژن ELTD1 کد کننده‌ی یک پروتئین متصل شونده به G-protein میباشد که به‌عنوان گیرنده فاکتور رشد عمل می‌کند و در رگزایی طبیعی و همچنین سرطانی شدن سلول‌ها نقش دارد. ازآنجایی‌که اثرات مثبت ملاتونین بر افزایش مرگ‌ومیر سلول‌های سرطانی و کاهش متاستاز و رگزایی ثابت شده است، بنابراین هدف از مطالعه حاضر ارزیابی میزان بیان ژن ELTD1 در سلول‌های سرطانی HT29 تیمار شده با ملاتونین به دو روش بیوانفورماتیکی و تجربی میباشد.
مواد و روش کار: ابتدا دادههای میکروآرایه از پایگاه داده GEO تهیه شد و با استفاده از جعبه‌ابزار شبکه عصبی (PNN ) در نرم‌افزار MATLAB 2018a آنالیز شد. سمیت سلولی ملاتونین به روش تست MTT ارزیابی شد. درنهایت Q-RT-PCR برای ارزیابی میزان بیان ژن ELTD1 در سلول‌های HT29 تیمار شده با ملاتونین استفاده شد.
یافته‌ها: نتایج مربوط به آنالیز بیوانفورماتیکی نشان داد که میزان بیان ژن ELDT1 در سلول‌های تیمار شده با ملاتونین در مقایسه با گروه کنترل به‌صورت قابل‌توجهی کاهش یافت. بررسی سمیت سلولی به روش تست MTT نشان داد که ملاتونین زیستایی سلول‌های HT29 را به‌صورت وابسته به غلظت دارو و زمان کاهش داد و غلظت IC50 (مهار 50درصد از رشد سلولی) در 48 ساعت برابر µM 160 محاسبه شد. به‌علاوه آنالیز مربوط به نتایج Q-RT-PCR نشان داد که ملاتونین میزان بیان ژن ELTD1 را به‌صورت معنیداری (P≤ 0.05 ) کاهش داد که هم سو با نتایج به‌دست‌آمده از آنالیز بیوانفورماتیکی میباشد.
بحث و نتیجه‌گیری: نتایج به‌دست‌آمده نشان میدهد که ژن ELTD1 میتواند به‌عنوان ژن هدف ملاتونین در درمان سرطان کلورکتال مورداستفاده قرار گیرد. اگرچه برای تأیید یافتههای مطالعه حاضر نیاز به مطالعات بیشتری است.
مواد و روش کار: ابتدا دادههای میکروآرایه از پایگاه داده GEO تهیه شد و با استفاده از جعبه‌ابزار شبکه عصبی (PNN ) در نرم‌افزار MATLAB 2018a آنالیز شد. سمیت سلولی ملاتونین به روش تست MTT ارزیابی شد. درنهایت Q-RT-PCR برای ارزیابی میزان بیان ژن ELTD1 در سلول‌های HT29 تیمار شده با ملاتونین استفاده شد.
یافته‌ها: نتایج مربوط به آنالیز بیوانفورماتیکی نشان داد که میزان بیان ژن ELDT1 در سلول‌های تیمار شده با ملاتونین در مقایسه با گروه کنترل به‌صورت قابل‌توجهی کاهش یافت. بررسی سمیت سلولی به روش تست MTT نشان داد که ملاتونین زیستایی سلول‌های HT29 را به‌صورت وابسته به غلظت دارو و زمان کاهش داد و غلظت IC50 (مهار 50درصد از رشد سلولی) در 48 ساعت برابر µM 160 محاسبه شد. به‌علاوه آنالیز مربوط به نتایج Q-RT-PCR نشان داد که ملاتونین میزان بیان ژن ELTD1 را به‌صورت معنیداری (P≤ 0.05 ) کاهش داد که هم سو با نتایج به‌دست‌آمده از آنالیز بیوانفورماتیکی میباشد.
بحث و نتیجه‌گیری: نتایج به‌دست‌آمده نشان میدهد که ژن ELTD1 میتواند به‌عنوان ژن هدف ملاتونین در درمان سرطان کلورکتال مورداستفاده قرار گیرد. اگرچه برای تأیید یافتههای مطالعه حاضر نیاز به مطالعات بیشتری است.
نوع مطالعه: پژوهشي(توصیفی- تحلیلی) |
موضوع مقاله:
اونکولوژی
ارسال پیام به نویسنده مسئول
| بازنشر اطلاعات | |
 |
این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است. |
