دوره 28، شماره 8 - ( ماهنامه آبان 1396 )
جلد 28 شماره 8 صفحات 41-33 |
برگشت به فهرست نسخه ها
FARNAZ BOROUMAND AZAD، کیوان تدیون، مجتبی نوفلی، رایناک قادری، محمد سخاوتی، سمانه سعیدی، معصومه فتاح مقدم، ابراهیم عباسی
موسسه تحقیقات واکسن و سرم رازی ، کرج ، ایران ، mmb093@gmail.com
چکیده: (12924 مشاهده)
زمینه و هدف: Bordetella pertussis ، عامل بیماری سرفه بزرگ ، همچنان در آن دسته از جمعیت هایی که نوزادان و کودکان به طور معمول واکسینه می شوند ، همچنان باعث آلوده شدن میزبان انسان می شود. علل اپیدمیولوژی سیاه سرفه کاملاً مشخص نشده است مگر اینکه سویه های پاتوژن با وسیله مولکولی مشخص شود. از نظر گلبالی ، تعداد متغیرهای چند متغیره از آزمایش تکرارهای پشت سر هم (MLVA) در نظارت بین آزمایشگاهی از مهمترین بیماریهای باکتریایی جهان بسیار مفید است. این کار به منظور بهبود روش تایپ MLVA فعلی توسعه یافته توسط Schouls در سال 2004 انجام شد.
مواد و روشها: در این مطالعه سلیکو به طور مقایسه ای بر روی کل ژنوم 5 سویه آزمایشگاهی و واکسنی B. pertussis سپرده شده در پایگاه داده های ژنوم NCBI با استفاده از نرم افزار Tandem Repeat Finder انجام شد. پروتکل های PCR سپس به منظور فعال کردن تقویت همزمان مکان های یافت شده به تصویب رسید. تجزیه و تحلیل ژنومی مقایسه ای بیشتر از 20 سویه شناخته شده در جهان B. pertussis از منشاء مختلف مکانی و زمانی با استفاده از مکان های جدید VNTR کشف شده انجام شد.
یافته ها: دو جایگاه پلی مورفیک تکرار پشت سر هم (TRS) با 6 (AAGCCC) و 9 (GGCTGGCCG) نوکلئوتیدها شناسایی شدند و به ترتیب VNTR9 و VNTR10 تعیین شدند. استفاده از این نمونه ها بر روی الگوهای ژنومی از گونه های واکسن B. pertussis 107 و B. pertussis 509 که توسط موسسه رازی در ساخت واکسن پتروسیس استفاده شده است ، منجر به تولید موفقیت آمیزه های PCR از هر دو سویه شد. شاخص های تنوع Nei از 0.38 و 0.1 توسط این مکان ها به ترتیب در تجزیه و تحلیل ژنومی مقایسه ای از گونه های B. pertussis از سراسر جهان بدست آمد.
نتیجه گیری: فرض می کنیم گنجاندن VNTR9 و VNTR10 در تجزیه و تحلیل MLVA ایزوله های بالینی B. pertussis در بهبود درک فعلی از سیاه سرفه در ایران مفید است.
مواد و روشها: در این مطالعه سلیکو به طور مقایسه ای بر روی کل ژنوم 5 سویه آزمایشگاهی و واکسنی B. pertussis سپرده شده در پایگاه داده های ژنوم NCBI با استفاده از نرم افزار Tandem Repeat Finder انجام شد. پروتکل های PCR سپس به منظور فعال کردن تقویت همزمان مکان های یافت شده به تصویب رسید. تجزیه و تحلیل ژنومی مقایسه ای بیشتر از 20 سویه شناخته شده در جهان B. pertussis از منشاء مختلف مکانی و زمانی با استفاده از مکان های جدید VNTR کشف شده انجام شد.
یافته ها: دو جایگاه پلی مورفیک تکرار پشت سر هم (TRS) با 6 (AAGCCC) و 9 (GGCTGGCCG) نوکلئوتیدها شناسایی شدند و به ترتیب VNTR9 و VNTR10 تعیین شدند. استفاده از این نمونه ها بر روی الگوهای ژنومی از گونه های واکسن B. pertussis 107 و B. pertussis 509 که توسط موسسه رازی در ساخت واکسن پتروسیس استفاده شده است ، منجر به تولید موفقیت آمیزه های PCR از هر دو سویه شد. شاخص های تنوع Nei از 0.38 و 0.1 توسط این مکان ها به ترتیب در تجزیه و تحلیل ژنومی مقایسه ای از گونه های B. pertussis از سراسر جهان بدست آمد.
نتیجه گیری: فرض می کنیم گنجاندن VNTR9 و VNTR10 در تجزیه و تحلیل MLVA ایزوله های بالینی B. pertussis در بهبود درک فعلی از سیاه سرفه در ایران مفید است.
نوع مطالعه: پژوهشي(توصیفی- تحلیلی) |
موضوع مقاله:
میکروبیولوژی
| بازنشر اطلاعات | |
 |
این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است. |