<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Studies in Medical Sciences</title>
<title_fa>مجله مطالعات علوم پزشکی</title_fa>
<short_title>Studies in Medical Sciences</short_title>
<subject>Medical Sciences</subject>
<web_url>http://umj.umsu.ac.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>37</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>journal37</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>2717-008X</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2717-008X</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii></journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.61882/umj</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid></journal_id_sid>
<journal_id_nlai></journal_id_nlai>
<journal_id_science></journal_id_science>
<language>en</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1403</year>
	<month>5</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2024</year>
	<month>8</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>35</volume>
<number>5</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>بررسی ایمونوانفورماتیک پروتئین OmpA اسینتوباکتر بومانی و مقایسه پاسخ‌های ایمنی القایی در بازه‌های زمانی متفاوت تزریق</title_fa>
	<title>IMMUNOINFORMATICS STUDY OF ACINETOBACTER BAUMANNII OMPA PROTEIN AND COMPARISON OF INDUCED IMMUNE RESPONSES IN DIFFERENT TIME INTERVALS OF INJECTION</title>
	<subject_fa>ایمونولوژی</subject_fa>
	<subject>ایمونولوژی</subject>
	<content_type_fa>پژوهشي(توصیفی- تحلیلی)</content_type_fa>
	<content_type>Research</content_type>
	<abstract_fa>&lt;span style=&quot;font-size:8.5pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:17pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;direction:rtl&quot;&gt;&lt;span style=&quot;unicode-bidi:embed&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:&amp;quot;Times New Roman&amp;quot;,serif&quot;&gt;&lt;b&gt;&lt;span lang=&quot;FA&quot; style=&quot;font-size:9.5pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Nazanin&quot;&gt;پیش&#8204;زمینه و هدف:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/b&gt; &lt;i&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot; style=&quot;font-size:9.5pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Nazanin&quot;&gt;اسینتوباکتر بومانی&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/i&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot; style=&quot;font-size:9.5pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Nazanin&quot;&gt; به&#8204;عنوان یکی از عوامل ایجادکننده عفونت بیمارستانی، سالانه باعث مرگ بسیاری از بیماران می&#8204;شود. استفاده از آنتی&#8204;بیوتیک&#8204;ها به دلیل مقاومت بالای این باکتری، کنترل عفونت&#8204;های ناشی از آن را با چالش روبه&#8204;رو کرده است. علاوه بر این تاکنون واکسن مؤثری برای این باکتری تولید نشده است. ازاین&#8204;رو در مطالعه حاضر با استفاده از ابزارهای ایمونوانفورماتیک پروتئین &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;OmpA&lt;span style=&quot;font-size:9.5pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Nazanin&quot;&gt; به&#8204;عنوان کاندید واکسن بررسی پاسخ&#8204;های ایمنی در زمان&#8204;بندی&#8204;های متفاوت تجویز آن بررسی شد تا علاوه بر معرفی یک کاندید واکسن، بهترین زمان&#8204;بندی تجویز آن&#8204;هم ارائه گردد.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;font-size:8.5pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:17pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;direction:rtl&quot;&gt;&lt;span style=&quot;unicode-bidi:embed&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:&amp;quot;Times New Roman&amp;quot;,serif&quot;&gt;&lt;b&gt;&lt;span lang=&quot;FA&quot; style=&quot;font-size:9.5pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Nazanin&quot;&gt;روش کار&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/b&gt;&lt;span lang=&quot;FA&quot; style=&quot;font-size:9.5pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Nazanin&quot;&gt;: &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot; style=&quot;font-size:9.5pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Nazanin&quot;&gt;در این مطالعه، پروتئین &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;OmpA&lt;span style=&quot;font-size:9.5pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Nazanin&quot;&gt; &lt;i&gt;اسینتوباکتر بومانی&lt;/i&gt; انتخاب گردید و با استفاده از پایگاه&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&#8204;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot; style=&quot;font-size:9.5pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Nazanin&quot;&gt;های ایمونوانفورماتیک اپی&#8204;توپ&#8204;های لنفوسیت&#8204;های &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;T&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot; style=&quot;font-size:9.5pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Nazanin&quot;&gt; و &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;B&lt;span style=&quot;font-size:9.5pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Nazanin&quot;&gt; پیش&#8204;بینی شد. سپس خاصیت آنتی&#8204;ژنی، عدم ایجاد حساسیت، سم زایی، خصوصیات فیزیکی و شیمیایی و توانایی اتصال به گیرنده&#8204;های ایمنی ذاتی و تطبیقی ارزیابی شد. درنهایت توانایی القاء پاسخ&#8204;های ایمنی در پنج برنامه تزریق مختلف موردبررسی قرار گرفت.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;FA&quot; style=&quot;font-size:9.5pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Nazanin&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;font-size:8.5pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:17pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;direction:rtl&quot;&gt;&lt;span style=&quot;unicode-bidi:embed&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:&amp;quot;Times New Roman&amp;quot;,serif&quot;&gt;&lt;b&gt;&lt;span lang=&quot;FA&quot; style=&quot;font-size:9.5pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Nazanin&quot;&gt;یافته&#8204;ها&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/b&gt;&lt;span lang=&quot;FA&quot; style=&quot;font-size:9.5pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Nazanin&quot;&gt;: &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot; style=&quot;font-size:9.5pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Nazanin&quot;&gt;نتایج حاصل نشان داد که &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;OmpA&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot; style=&quot;font-size:9.5pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Nazanin&quot;&gt; پروتئینی با خاصیت آنتی&#8204;ژنی، بی&#8204;خطر، آب دوست با قابلیت حلالیت مناسب است. این پروتئین توانایی اتصال به گیرنده&#8204;های ایمنی ذاتی و تطبیقی را دارد و همچنین در تزریق سه نوبته و چهار نوبته توانایی القاء پاسخ ایمنی هومورال و سلولی را دارد.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;FA&quot; style=&quot;font-size:9.5pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Nazanin&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;font-size:8.5pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:17pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;direction:rtl&quot;&gt;&lt;span style=&quot;unicode-bidi:embed&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:&amp;quot;Times New Roman&amp;quot;,serif&quot;&gt;&lt;b&gt;&lt;span lang=&quot;FA&quot; style=&quot;font-size:9.5pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Nazanin&quot;&gt;بحث و نتیجه&#8204;گیری&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/b&gt;&lt;span lang=&quot;FA&quot; style=&quot;font-size:9.5pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Nazanin&quot;&gt;: &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot; style=&quot;font-size:9.5pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Nazanin&quot;&gt;درمجموع این مطالعه نشان می&#8204;دهد که &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;OmpA&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot; style=&quot;font-size:9.5pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Nazanin&quot;&gt; علاوه بر خاصیت ایمنی&#8204;زایی به&#8204;عنوان کاندید واکسن با تجویز سه نوبته توانایی القاء واسطه&#8204;های ایمنی را دارد بااین&#8204;حال تجویز چهارنوبته این پروتئین پاسخ ایمنی قوی&#8204;تری را ایجاد می&#8204;کند.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;FA&quot; style=&quot;font-size:9.5pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Nazanin&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;font-size:8.5pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:17pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;direction:rtl&quot;&gt;&lt;span style=&quot;unicode-bidi:embed&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:&amp;quot;Times New Roman&amp;quot;,serif&quot;&gt;&lt;span lang=&quot;FA&quot; style=&quot;font-size:9.5pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Nazanin&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;FA&quot; style=&quot;font-size:9.5pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Nazanin&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;</abstract_fa>
	<abstract>&lt;span style=&quot;font-size:11pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:normal&quot;&gt;&lt;span style=&quot;unicode-bidi:embed&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:&amp;quot;Calibri&amp;quot;,sans-serif&quot;&gt;&lt;a name=&quot;_Toc416081061&quot;&gt;&lt;b&gt;&lt;i&gt;&lt;span lang=&quot;X-NONE&quot; style=&quot;font-family:&amp;quot;Times New Roman&amp;quot;,serif&quot;&gt;Background &amp;&lt;/span&gt;&lt;/i&gt;&lt;/b&gt;&lt;/a&gt;&lt;b&gt;&lt;i&gt; &lt;/i&gt;&lt;/b&gt;&lt;b&gt;&lt;i&gt;&lt;span lang=&quot;X-NONE&quot; style=&quot;font-family:&amp;quot;Times New Roman&amp;quot;,serif&quot;&gt;Aims&lt;/span&gt;&lt;/i&gt;&lt;/b&gt;&lt;span lang=&quot;X-NONE&quot; style=&quot;font-family:&amp;quot;Times New Roman&amp;quot;,serif&quot;&gt;: &lt;/span&gt;&lt;i&gt;&lt;span lang=&quot;X-NONE&quot; style=&quot;font-family:&amp;quot;Times New Roman&amp;quot;,serif&quot;&gt;Acinetobacter baumannii&lt;/span&gt;&lt;/i&gt;&lt;span lang=&quot;X-NONE&quot; style=&quot;font-family:&amp;quot;Times New Roman&amp;quot;,serif&quot;&gt;, as one of the causes of hospital infection, causes the death of many patients every year. Due to the high antibiotic resistance, controlling the infections has faced a challenge. In addition, no effective vaccine has been produced for this bacterium. Therefore, in the present study, using immunoinformatics tools, OmpA protein as a vaccine candidate was used to investigate the immune responses in different time points of administration so that in addition to introducing a vaccine candidate, the best timing of its administration was also provided.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;font-size:11pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:normal&quot;&gt;&lt;span style=&quot;unicode-bidi:embed&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:&amp;quot;Calibri&amp;quot;,sans-serif&quot;&gt;&lt;b&gt;&lt;i&gt;&lt;span lang=&quot;X-NONE&quot; style=&quot;font-family:&amp;quot;Times New Roman&amp;quot;,serif&quot;&gt;Methods&lt;/span&gt;&lt;/i&gt;&lt;/b&gt;&lt;span lang=&quot;X-NONE&quot; style=&quot;font-family:&amp;quot;Times New Roman&amp;quot;,serif&quot;&gt;: In this study, The &lt;i&gt;Acinetobacter baumannii&lt;/i&gt; OmpA protein was chosen and the epitopes of T and B lymphocytes were predicted using immunoinformatics servers. Then, the antigenic properties, non-allergenicity, non-toxicity, physical and chemical properties, and binding ability to innate and adaptive immune receptors were evaluated. Finally, the ability to induce immune responses in five different injection programs was investigated.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;font-size:11pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:normal&quot;&gt;&lt;span style=&quot;unicode-bidi:embed&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:&amp;quot;Calibri&amp;quot;,sans-serif&quot;&gt;&lt;b&gt;&lt;i&gt;&lt;span lang=&quot;X-NONE&quot; style=&quot;font-family:&amp;quot;Times New Roman&amp;quot;,serif&quot;&gt;Results&lt;/span&gt;&lt;/i&gt;&lt;/b&gt;&lt;span lang=&quot;X-NONE&quot; style=&quot;font-family:&amp;quot;Times New Roman&amp;quot;,serif&quot;&gt;: The results showed that OmpA is an antigenic, safe, hydrophilic protein with good solubility. This protein can bind to innate and adaptive immune receptors and can induce humoral and cellular immune responses in three-time and four-time injections.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;font-size:11pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:normal&quot;&gt;&lt;span style=&quot;unicode-bidi:embed&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:&amp;quot;Calibri&amp;quot;,sans-serif&quot;&gt;&lt;b&gt;&lt;i&gt;&lt;span lang=&quot;X-NONE&quot; style=&quot;font-family:&amp;quot;Times New Roman&amp;quot;,serif&quot;&gt;Conclusion&lt;/span&gt;&lt;/i&gt;&lt;/b&gt;&lt;span lang=&quot;X-NONE&quot; style=&quot;font-family:&amp;quot;Times New Roman&amp;quot;,serif&quot;&gt;: In total, this study shows that OmpA, in addition to its immunogenic properties, as a vaccine candidate, can induce immune mediators by administering it three times, however, four times administrations of this protein create a stronger immune response.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;</abstract>
	<keyword_fa>اسینتوباکتر بومانی, زمان‌بندی تزریق, واکسن, OmpA</keyword_fa>
	<keyword>Acinetobacter baumannii, injection timing, vaccine, OmpA</keyword>
	<start_page>350</start_page>
	<end_page>360</end_page>
	<web_url>http://umj.umsu.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-5692-1&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Sana</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Yousefian Jazi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>ثناء</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>یوسفیان جزی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>sanayousefian@bio.ui.ac.ir</email>
	<code>3700319475328460036051</code>
	<orcid>3700319475328460036051</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Cell and Molecular Biology &amp; Microbiology, Faculty of Biological Science and Technology, University of Isfahan, Isfahan, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه زیست‌شناسی سلولی مولکولی و میکروبیولوژی، دانشکده علوم و فناوری‌های زیستی، دانشگاه اصفهان، اصفهان، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Babak</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Beikzadeh</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>بابک</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>بیک زاده</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>b.beikzadeh@bio.ui.ac.ir</email>
	<code>3700319475328460036052</code>
	<orcid>3700319475328460036052</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>Assistant Professor, Department of Cell and Molecular Biology and Microbiology, Faculty of Biological Science and Technology, University of Isfahan, Isfahan, Iran (Corresponding Author)</affiliation>
	<affiliation_fa>استادیار ایمنی شناسی، گروه زیست‌شناسی سلولی مولکولی و میکروبیولوژی، دانشکده علوم و فناوری‌های زیستی، دانشگاه اصفهان، اصفهان، ایران (نویسنده مسئول)</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
