<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Studies in Medical Sciences</title>
<title_fa>مجله مطالعات علوم پزشکی</title_fa>
<short_title>Studies in Medical Sciences</short_title>
<subject>Medical Sciences</subject>
<web_url>http://umj.umsu.ac.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>37</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>journal37</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>2717-008X</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2717-008X</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii></journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.61882/umj</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid></journal_id_sid>
<journal_id_nlai></journal_id_nlai>
<journal_id_science></journal_id_science>
<language>en</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1402</year>
	<month>8</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2023</year>
	<month>11</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>34</volume>
<number>8</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>en</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>بررسی شیوع اشریشیا آلبرتی در نمونه های ادرار و مدفوع در کرمانشاه، ایران</title_fa>
	<title>An Investigation on the Prevalence of Escherichia Albertii in Urine and Stool Samples of Patients in Kermanshah, Iran</title>
	<subject_fa>میکروبیولوژی</subject_fa>
	<subject>میکروبیولوژی</subject>
	<content_type_fa>پژوهشي(توصیفی- تحلیلی)</content_type_fa>
	<content_type>Research</content_type>
	<abstract_fa>&lt;span style=&quot;font-size:8.5pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:17pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;direction:rtl&quot;&gt;&lt;span style=&quot;unicode-bidi:embed&quot;&gt;&lt;span new=&quot;&quot; roman=&quot;&quot; style=&quot;font-family:&quot; times=&quot;&quot;&gt;&lt;b&gt;&lt;span lang=&quot;FA&quot; style=&quot;font-size:9.5pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Nazanin&quot;&gt;پیش&#8204;زمینه و هدف:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/b&gt; &lt;i&gt;Escherichia albertii&lt;/i&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.5pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Nazanin&quot;&gt; یک باکتری گرم منفی و بی هوازی اختیاری است که در سال های اخیر به عنوان عامل ایجادکننده اسهال جدا شده است. به دلیل نبود اطلاعات کافی در مورد خصوصیات فنوتیپی و بیوشیمیایی این باکتری، تشخیص آن از سایر گونه های انتروباکتریاسه به ویژه پاتوتیپ های &lt;i&gt;اشریشیا کلی&lt;/i&gt; دشوار است. لذا هدف از این مطالعه بررسی شیوع &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;i&gt;E. albertii&lt;/i&gt;&lt;span lang=&quot;FA&quot; style=&quot;font-size:9.5pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Nazanin&quot;&gt; در نمونه ادرار و مدفوع بیماران مراجعه کننده به بیمارستان های کرمانشاه با استفاده از روش های کشت و مولکولی می باشد.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot; style=&quot;font-size:9.5pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Nazanin&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;font-size:8.5pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:17pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;direction:rtl&quot;&gt;&lt;span style=&quot;unicode-bidi:embed&quot;&gt;&lt;span new=&quot;&quot; roman=&quot;&quot; style=&quot;font-family:&quot; times=&quot;&quot;&gt;&lt;b&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot; style=&quot;font-size:9.5pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Nazanin&quot;&gt;مواد و روش&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/b&gt;&lt;b&gt;&lt;span lang=&quot;FA&quot; style=&quot;font-size:9.5pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Nazanin&quot;&gt; کار&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/b&gt;&lt;b&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot; style=&quot;font-size:9.5pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Nazanin&quot;&gt;: &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/b&gt;&lt;span lang=&quot;FA&quot; style=&quot;font-size:9.5pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Nazanin&quot;&gt;400 نمونه با فنوتیپ تأیید شده به عنوان انتروباکتریاسه جمع آوری شد و پس از کشت مجدد و انجام تست های بیوشیمیایی، در نهایت کلنی های سفید روی &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;XRM-McConkey&lt;span lang=&quot;FA&quot; style=&quot;font-size:9.5pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Nazanin&quot;&gt; آگار ( مشکوک به &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;i&gt;E. albertii&lt;/i&gt;&lt;span lang=&quot;FA&quot; style=&quot;font-size:9.5pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Nazanin&quot;&gt;) انتخاب و با استفاده از پرایمر اختصاصی برای ژن&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;cdt &amp;nbsp;(Eacdt)&lt;span lang=&quot;FA&quot; style=&quot;font-size:9.5pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Nazanin&quot;&gt; مورد تست &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;PCR&lt;span lang=&quot;FA&quot; style=&quot;font-size:9.5pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Nazanin&quot;&gt; قرار گرفتند.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot; style=&quot;font-size:9.5pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Nazanin&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;font-size:8.5pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:17pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;direction:rtl&quot;&gt;&lt;span style=&quot;unicode-bidi:embed&quot;&gt;&lt;span new=&quot;&quot; roman=&quot;&quot; style=&quot;font-family:&quot; times=&quot;&quot;&gt;&lt;b&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot; style=&quot;font-size:9.5pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Nazanin&quot;&gt;یافته&#8204;ها: &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/b&gt;&lt;span lang=&quot;FA&quot; style=&quot;font-size:9.5pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Nazanin&quot;&gt;تنها 5 نمونه (25/1%) در کشت نهایی روی &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;XRM-MacConkey&lt;span lang=&quot;FA&quot; style=&quot;font-size:9.5pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Nazanin&quot;&gt; آگار مثبت بودند. هیچ یک از آنها در &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;PCR&lt;span lang=&quot;FA&quot; style=&quot;font-size:9.5pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Nazanin&quot;&gt; به عنوان &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;i&gt;E. albertii&lt;/i&gt;&lt;span lang=&quot;FA&quot; style=&quot;font-size:9.5pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Nazanin&quot;&gt; تایید نشد.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot; style=&quot;font-size:9.5pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Nazanin&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;font-size:8.5pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:17pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;direction:rtl&quot;&gt;&lt;span style=&quot;unicode-bidi:embed&quot;&gt;&lt;span new=&quot;&quot; roman=&quot;&quot; style=&quot;font-family:&quot; times=&quot;&quot;&gt;&lt;b&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot; style=&quot;font-size:9.5pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Nazanin&quot;&gt;بحث و نتیجه&#8204;گیری&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/b&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot; style=&quot;font-size:9.5pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Nazanin&quot;&gt;: &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;FA&quot; style=&quot;font-size:9.5pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Nazanin&quot;&gt;به نظر می رسد استفاده از پرایمر اختصاصی &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;Eacdt&lt;span lang=&quot;FA&quot; style=&quot;font-size:9.5pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Nazanin&quot;&gt; برای تشخیص این باکتری کارآمد نباشد. با این حال، مطالعات بیشتری برای تأیید آن توصیه می شود.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&amp;nbsp;</abstract_fa>
	<abstract>&lt;div style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:18.0pt&quot;&gt;&lt;span new=&quot;&quot; roman=&quot;&quot; style=&quot;font-family:&quot; times=&quot;&quot;&gt;&lt;b&gt;&lt;i&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt&quot;&gt;Background &amp; Aims:&lt;/span&gt;&lt;/i&gt;&lt;/b&gt;&lt;b&gt; &lt;/b&gt;&lt;i&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt&quot;&gt;Escherichia albertii&lt;/span&gt;&lt;/i&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt&quot;&gt; is a gram-negative and facultatively anaerobic bacterium that has been isolated as a causative agent of diarrhea in recent years. Due to the lack of sufficient information on the phenotypic and biochemical characteristics of this bacterium, it is difficult to distinguish it from other species of the Enterobacteriaceae, especially &lt;i&gt;Escherichia coli&lt;/i&gt; pathotypes. So, the aim of this study was to evaluate the prevalence of &lt;i&gt;E. albertii&lt;/i&gt; in the urine and stool samples of patients with urinary tract and gastrointestinal tract infection in Kermanshah hospitals using culture and molecular methods.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;font-size:12pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:18.0pt&quot;&gt;&lt;span new=&quot;&quot; roman=&quot;&quot; style=&quot;font-family:&quot; times=&quot;&quot;&gt;&lt;b&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt&quot;&gt;Materials &amp; Methods&lt;/span&gt;&lt;/b&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt&quot;&gt;: Four hundred samples consisted of 200 urine and 200 stool samples confirmed as Enterobacteriaceae phenotypically were collected. After subculture and biochemical tests, finally white colonies on XRM-McConkey agar (suspected to be &lt;i&gt;E. albertii&lt;/i&gt;) were selected and subjected to PCR using specific primer for &lt;i&gt;cdt&lt;/i&gt; gene (&lt;i&gt;Eacdt&lt;/i&gt;). SPSS version 16 software was used for the statistical analysis of the data, and the p-value less than 0.05 was considered statistically significant.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;font-size:12pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:18.0pt&quot;&gt;&lt;span new=&quot;&quot; roman=&quot;&quot; style=&quot;font-family:&quot; times=&quot;&quot;&gt;&lt;b&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt&quot;&gt;Results&lt;/span&gt;&lt;/b&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt&quot;&gt;: Only 5 samples (1.25%) were positive in the final culture on XRM-MacConkey agar. None of them were then confirmed as &lt;i&gt;E. albertii&lt;/i&gt; by the PCR.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;font-size:12pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:18.0pt&quot;&gt;&lt;span new=&quot;&quot; roman=&quot;&quot; style=&quot;font-family:&quot; times=&quot;&quot;&gt;&lt;b&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt&quot;&gt;Conclusion&lt;/span&gt;&lt;/b&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt&quot;&gt;: According to the phenotypic isolation of this bacterium in present study and previous studies on the prevalence of it, it seems that the use of &lt;i&gt;Eacdt&lt;/i&gt; specific primer is not efficient for the detection of this bacterium. However, further studies are recommended to confirm it.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/div&gt;</abstract>
	<keyword_fa>اشرشیا آلبرتی, انتروباکتریاسه, ادرار, مدفوع, کرمانشاه, PCR</keyword_fa>
	<keyword>Enterobacteriaceae, Escherichia Albertii, Kermanshah, PCR, Stool, Urine</keyword>
	<start_page>479</start_page>
	<end_page>485</end_page>
	<web_url>http://umj.umsu.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-5458-1&amp;slc_lang=en&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Azadeh</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Foroughi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>آزاده</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>فروغی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>a.foroughi@razi.ac.ir</email>
	<code>3700319475328460034189</code>
	<orcid>3700319475328460034189</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>Department of Pathobiology &amp; Basic Science, Veterinary Science Faculty, Razi University, Kermanshah, Iran (Corresponding Author)</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه علوم پایه و پاتوبیولوژی، دانشکده دامپزشکی، دانشگاه رازی، کرمانشاه، ایران (نویسنده مسئول)</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Keyghobad</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Ghadiri</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>کیقباد</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>قدیری</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>k_ghadiri@yahoo.com</email>
	<code>3700319475328460034190</code>
	<orcid>3700319475328460034190</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Infectious Disease Research Center, Health Institute, Kermanshah University of Medical Sciences, Kermanshah, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>مرکز تحقیقات بیماری های عفونی، پژوهشکده سلامت، دانشگاه علوم پزشکی کرمانشاه، کرمانشاه، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Arezoo</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Bozorgomid</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>آرزو</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>بزرگ امید</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>arezoobzorgomid@yahoo.com</email>
	<code>3700319475328460034191</code>
	<orcid>3700319475328460034191</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Infectious Disease Research Center, Health Institute, Kermanshah University of Medical Sciences, Kermanshah, Iran.</affiliation>
	<affiliation_fa>مرکز تحقیقات بیماری های عفونی، پژوهشکده سلامت، دانشگاه علوم پزشکی کرمانشاه، کرمانشاه، ایران.</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Roya</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Chegeneh Lorestani</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>رویا</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>چگنه لرستانی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>lorestani25@gmail.com</email>
	<code>3700319475328460034192</code>
	<orcid>3700319475328460034192</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Infectious Disease Research Center, Health Institute, Kermanshah University of Medical Sciences, Kermanshah, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>مرکز تحقیقات بیماری های عفونی، پژوهشکده سلامت، دانشگاه علوم پزشکی کرمانشاه، کرمانشاه، ایران.</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Somayeh</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Jafari</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>سمیه</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>جعفری</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>bartar2004@yahoo.com</email>
	<code>3700319475328460034193</code>
	<orcid>3700319475328460034193</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Clinical Research Development Center, Imam Reza Hospital, Kermanshah University of Medical Sciences, Kermanshah, Iran.</affiliation>
	<affiliation_fa>واحد توسعه تحقیقات بالینی بیمارستان امام رضا (ع)، دانشگاه علوم پزشکی کرمانشاه، کرمانشاه، ایران.</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
